معلومة

8.9: تزداد تعقيدًا: تنظيم الجينات في حقيقيات النوى - علم الأحياء

8.9: تزداد تعقيدًا: تنظيم الجينات في حقيقيات النوى - علم الأحياء


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

في هذه المرحلة ، لن نأخذ الكثير من الوقت للدخول في كيفية اختلاف التعبير الجيني على وجه الخصوص ، والتخليق متعدد الببتيد بشكل عام بين بدائيات النوى وحقيقيات النوى باستثناء الإشارة إلى بعض الاختلافات الرئيسية ، والتي سنعود إلى بعضها ، ولكن سيكون معظمها مناسبًا فقط في الدورات التدريبية الأكثر تخصصًا. تم العثور أيضًا على حدوث تمزقات في الغلاف النووي عند محاولة الخلايا المهاجرة الضغط من خلال فتحات صغيرة243. بمجرد إعادة تأسيس سلامة الغلاف النووي ، تعود البروتينات التي تحتوي على تسلسل NLS و NES إلى موقعها المناسب داخل الخلية.

بصرف النظر عن تلك الموجودة داخل الميتوكوندريا والبلاستيدات الخضراء ، توجد جزيئات الحمض النووي للخلايا حقيقية النواة داخل النواة. أحد الاختلافات بين الجينات حقيقية النواة والجينات البكتيرية هو أن المنطقة المنسوخة من الجينات حقيقية النواة تحتوي غالبًا على ما يعرف بالتسلسلات المتداخلة أو الإنترونات. تتضمن الإنترونات متواليات لا تكوّد عديد ببتيد. بعد تصنيع الحمض النووي الريبي ، يتم إزالة الإنترونات إنزيميًا ، مما ينتج عنه مرنا أقصر. كنقطة اهتمام ، يمكن تنظيم أي التسلسلات تتم إزالتها ، يمكن أن ينتج عن ذلك عدة mRNAs مختلفة من نفس الجين ، mRNAs التي تشفر إلى حد ما (وغالبًا ما تكون وظيفية) عديد ببتيدات مختلفة. بالإضافة إلى إزالة الإنترونات ، يتم تعديل (معالجة) mRNA بشكل إضافي عند نهايتيه 5 و 3. فقط بعد حدوث معالجة الحمض النووي الريبي ، يتم تصدير الرنا المرسال "الناضج" الآن من النواة ، عبر المسام النووي ، إلى السيتوبلاس حيث يمكنه التفاعل مع الريبوسومات. يتمثل أحد الاختلافات الأخرى عن البكتيريا في أن التفاعل بين mRNA الناضج والوحدة الفرعية الريبوسومية الصغيرة ينطوي على تكوين معقد يتم فيه تجميع طرفي الرنا المرسال 5 "و 3" معًا في دائرة. النقطة المهمة هنا هي أنه على عكس الحالة في البكتيريا ، حيث يتم تصنيع الرنا المرسال في السيتوبلازم وبالتالي يمكن أن تتفاعل على الفور مع الريبوسومات وتبدأ في الترجمة (حتى قبل الانتهاء من تخليق الحمض النووي الريبي) النسخ والترجمة هما عمليتان متميزتان في حقيقيات النوى. يجعل توليد رنا متعددة ومتميزة وظيفيًا (من خلال معالجة الرنا المرسال) من جين واحد ممكنًا ويؤدي إلى تعقيد أكبر بشكل ملحوظ من زيادة صغيرة نسبيًا في عدد الجينات.


التقى أكثر من 400 عالم في نهاية يناير 2016 في مدينة غينت الجميلة ببلجيكا. كان الاجتماع المنظم جيدًا هو الثاني في سلسلة تهدف إلى التركيز على هندسة الجينوم والبيولوجيا التركيبية. كانت البيولوجيا التركيبية موضوعًا ساخنًا لعدد من السنوات. إن التطوير الأخير لأدوات الهندسة باستخدام التكرارات القصيرة المتناوبة العنقودية والمتباعدة بانتظام (CRISPR) إلى جانب نوكلياز (Cas) المرتبط بـ CRISPR (ما يسمى بتقنية CRISPR / Cas) ، وتطبيقاتها المتزايدة ، تعمل حاليًا على إحداث ثورة في علم الأحياء. ليس من المستغرب أن تتفوق CRISPR / Cas خلال الاجتماع على جميع الموضوعات الأخرى. أدى ذلك إلى اعتذار بعض المتحدثين لعدم الحديث عن تقنية CRISPR / Cas. وبالتالي ، فإن تقرير الاجتماع هذا سوف يسلط الضوء بشكل أساسي على التقدم الأخير في هندسة الجينوم.

عند لقاء المئات من العلماء المتحمسين الذين يعملون مع تقنية CRISPR / Cas ، كان من الصعب تصديق أن المؤتمر كان ينعقد بعد ثلاث سنوات فقط من نشر التقارير الأولى التي كشفت أن نظام CRISPR / Cas يمكن استخدامه كأداة فعالة للجينوم الهندسة في حقيقيات النوى العليا.

لقد كان قرارًا سليمًا من قبل المنظمين لبدء الاجتماع بمحادثة عامة بواسطة Jin-Soo Kim من جامعة سيول الوطنية ، كوريا. قدم حديثه بشكل جيد بعض الجوانب الأكثر مناقشة حاليًا لتقنية CRISPR / Cas ، مثل الكشف عن الآثار الجانبية والقضاء عليها ، فضلاً عن توسيع نطاق تطبيقها. قدم طريقة جديدة ، تسمى "مضاعف Digenome-seq" ، لتوصيف خصائص التأثير خارج الهدف على نطاق الجينوم لنويدات كريسبر- Cas9 المتعددة في وقت واحد. تعتمد هذه التقنية على هضم الحمض النووي الجيني البشري الخالي من الخلايا ، متبوعًا بتسلسل الجينوم الكامل. هناك خيار آخر لتقليل التأثيرات غير المستهدفة وهو التحكم بإحكام في نشاط الإنزيم. بدلاً من تحويل الحمض النووي الذي يشفر نوكلياز Cas9 والدليل الفردي RNA (sgRNA) ، تم نقل مجمعات مجمعة مسبقًا من بروتين Cas9 المنقى و sgRNA بنجاح بواسطة العلماء الكوريين إلى خلايا. وبالتالي ، يمكن تجنب التعبير المستمر عن الإنزيم ، والذي من شأنه أن يعزز التأثيرات غير المستهدفة بمرور الوقت. والجدير بالذكر أن هذا النهج ليس فقط جذابًا لخلايا الثدييات ولكن أيضًا لنباتات المحاصيل - مثل هذه النباتات لا تتلامس أبدًا مع الحمض النووي المعدل وراثيًا ، ولكنها تحتوي على عمليات إدخال صغيرة أو عمليات حذف لا يمكن تمييزها عن الطفرات التي تحدث بشكل طبيعي. نأمل ألا يتم اعتبار هذه النباتات كائنات معدلة وراثيًا في جميع أنحاء العالم.

ليس فقط في التكنولوجيا الحيوية ، ولكن أيضًا في الطب ، يمكن اتباع طرق جديدة من خلال تطبيق CRISPR / Cas: الهيموفيليا A هو اضطراب وراثي مرتبط بـ X ناتج عن طفرات في الجين الذي يشفر عامل تخثر الدم الثامن ، والذي غالبًا ما يكون انقلابات صبغية. أصبحت مجموعة كيم الآن (أو كانت) قادرة على عكس هذه الانقلابات الصبغية في الخلايا الجذعية المستحثة متعددة القدرات (iPSCs) المشتقة من المرضى. وبالتالي ، على المدى الطويل ، ستصبح التطبيقات العلاجية المستندة إلى CRISPR / Cas خيارًا لمحاربة هذا المرض.


التحكم في التعبير الجيني في حقيقيات النوى

تمتلك الخلايا حقيقية النواة آليات مماثلة للتحكم في التعبير الجيني ، لكنها أكثر تعقيدًا. ضع في اعتبارك ، على سبيل المثال ، أن الخلايا بدائية النواة لنوع معين كلها متشابهة ، لكن معظم حقيقيات النوى هي كائنات متعددة الخلايا لها العديد من أنواع الخلايا ، لذا فإن التحكم في التعبير الجيني أكثر تعقيدًا. ليس من المستغرب أن يتم التحكم في التعبير الجيني في الخلايا حقيقية النواة من خلال عدد من العمليات المعقدة التي تتلخص في القائمة التالية.

  • بعد الإخصاب ، تصبح الخلايا في الجنين النامي متخصصة بشكل متزايد ، إلى حد كبير عن طريق تشغيل بعض الجينات وإيقاف العديد من الجينات الأخرى. بعض الخلايا في البنكرياس ، على سبيل المثال ، متخصصة في تصنيع وإفراز إنزيمات الجهاز الهضمي ، بينما تتخصص خلايا البنكرياس الأخرى (& # 946 خلية في جزر لانجرهانز) في تخليق وإفراز الأنسولين. كل نوع من الخلايا له نمط معين من الجينات المعبر عنها. يحدث هذا التمايز إلى خلايا متخصصة إلى حد كبير نتيجة لإيقاف التعبير عن معظم الجينات في الخلايا الناضجة للخلية ، وقد تستخدم فقط 3-5 ٪ من الجينات الموجودة في نواة الخلية.
  • يمكن أيضًا تنظيم التعبير الجيني في حقيقيات النوى من خلال التعديلات في حزم الحمض النووي ، والتي تعدل وصول إنزيمات النسخ في الخلية (على سبيل المثال ، بوليميريز الحمض النووي الريبي) إلى الحمض النووي. يوضح الرسم التوضيحي أدناه أن الكروموسومات لها بنية معقدة. يتم لف حلزون الحمض النووي حول بروتينات خاصة تسمى الهستونات ، ويتم لفها في ألياف حلزونية ضيقة. ثم يتم لف هذه الألياف وطيها في هياكل مضغوطة بشكل متزايد ، والتي ، عند لفها وتكثيفها بالكامل ، تعطي الكروموسومات مظهرها المميز في الطور الطوري.

  • على غرار الأوبراونات الموصوفة أعلاه بالنسبة إلى بدائيات النوى ، تستخدم حقيقيات النوى أيضًا بروتينات تنظيمية للتحكم في النسخ ، لكن كل جين حقيقي النواة له مجموعة عناصر تحكم خاصة به. بالإضافة إلى ذلك ، هناك الكثير البروتينات التنظيمية في حقيقيات النوى والتفاعلات أكثر تعقيدًا.
  • يحدث النسخ في حقيقيات النوى داخل النواة المرتبطة بالغشاء ، ويتم تعديل النسخة الأولية قبل نقلها من النواة إلى السيتوبلازم للترجمة في الريبوسوم s. يحتوي النص الأولي في حقيقيات النوى على مقاطع ترميز (exons) بالتناوب مع مقاطع غير مشفرة (introns). قبل أن يغادر mRNA النواة ، تتم إزالة الإنترونات من النسخة بواسطة عملية تسمى RNA splicing (انظر الرسم والفيديو أدناه) ، وتضاف نيوكليوتيدات إضافية إلى نهايات النص. تهاجمه الإنزيمات الخلوية وتساعد في التعرف على الريبوسومات.

  • يوفر التباين في طول عمر الرنا المرسال فرصة أخرى للتحكم في التعبير الجيني. mRNA بدائية النواة قصير العمر جدًا ، لكن نسخ حقيقيات النوى يمكن أن تستمر لساعات ، أو أحيانًا حتى أسابيع (على سبيل المثال ، mRNA للهيموجلوبين في خلايا الدم الحمراء للطيور).
  • تقدم عملية الترجمة فرصًا إضافية للتنظيم بواسطة العديد من البروتينات. على سبيل المثال ، يتم منع ترجمة الهيموجلوبين mRNA ما لم يكن الهيم المحتوي على الحديد موجودًا في الخلية.
  • هناك أيضًا فرص لـ & quotpost-translational & quot عناصر التحكم في التعبير الجيني في حقيقيات النوى. يتم تقطيع بعض الببتيدات المترجمة (البروتينات) بواسطة الإنزيمات إلى منتجات نهائية أصغر ونشطة. كما هو موضح في الشكل أدناه والذي يصور المعالجة اللاحقة لهرمون الأنسولين. يُترجم الأنسولين مبدئيًا على أنه سلائف كبيرة غير نشطة ، حيث يتم إزالة تسلسل إشارة من رأس السلائف ، ويتم قطع جزء مركزي كبير (السلسلة C) ، تاركًا سلسلتين صغيرتين من الببتيد يتم ربطهما ببعضهما البعض عن طريق جسور ثاني كبريتيد الشكل النهائي الأصغر هو الشكل النشط للأنسولين.
  • يمكن أيضًا تعديل التعبير الجيني عن طريق انهيار البروتينات التي يتم إنتاجها. على سبيل المثال ، يتم تفكيك بعض الإنزيمات المشاركة في استقلاب الخلية بعد وقت قصير من إنتاجها ، مما يوفر آلية للاستجابة السريعة لمتطلبات التمثيل الغذائي المتغيرة.
  • يمكن أيضًا أن يتأثر التعبير الجيني بإشارات من خلايا أخرى. هناك العديد من الأمثلة التي يرتبط فيها جزيء الإشارة (على سبيل المثال ، هرمون) من خلية واحدة ببروتين مستقبل في خلية مستهدفة ويبدأ سلسلة من التغييرات الكيميائية الحيوية (مسار تحويل الإشارة) التي تؤدي إلى تغييرات داخل الخلية المستهدفة. يمكن أن تشمل هذه التغييرات زيادة أو نقصان النسخ كما هو موضح في الشكل أدناه.

  • نظام تداخل الحمض النووي الريبي (RNAi) هو آلية أخرى تتحكم بها الخلايا في التعبير الجيني عن طريق إيقاف ترجمة mRNA. يمكن أيضًا استخدام RNAi لإيقاف ترجمة البروتينات الفيروسية عند إصابة الخلية بفيروس. يتمتع نظام RNAi أيضًا بإمكانية استغلاله علاجيًا.

سوف تغزو بعض فيروسات الحمض النووي الريبي الخلايا وتدخل الحمض النووي الريبي مزدوج الشريطة والذي سيستخدم آلية الخلايا لعمل نسخ جديدة من الحمض النووي الريبي الفيروسي والبروتينات الفيروسية. يمكن لنظام تداخل الحمض النووي الريبي في الخلية (RNAi) منع الحمض النووي الريبي الفيروسي من التكاثر. أولاً ، يقوم الإنزيم المسمى & quotDicer & quot بتقطيع أي RNA مزدوج الشريطة يجده إلى قطع يبلغ طولها حوالي 22 نيوكليوتيد. بعد ذلك ، ترتبط معقدات البروتين المسماة RISC (مجمع الصمت الناجم عن الحمض النووي الريبي) بشظايا الحمض النووي الريبي المزدوج الشريطة ، وتلفها ، ثم تطلق أحد الخيوط ، مع الاحتفاظ بالآخر. سوف يرتبط معقد RISC-RNA بعد ذلك بأي رنا فيروسي آخر مع تسلسلات نيوكليوتيد مطابقة لتلك الموجودة على RNA المرتبط بالمجمع. يمنع هذا الارتباط ترجمة البروتينات الفيروسية جزئيًا على الأقل ، إن لم يكن بالكامل. يمكن استخدام نظام RNAi لتطوير علاجات للجينات المعيبة التي تسبب المرض. سيشمل العلاج صنع RNA مزدوج الشريطة من الجين المصاب وإدخاله في الخلايا لإسكات التعبير عن هذا الجين. للحصول على شرح توضيحي لـ RNAi ، راجع وحدة الفلاش التفاعلية القصيرة على http://www.pbs.org/wgbh/nova/body/rnai-explained.html

تم أيضًا شرح نظام تداخل الحمض النووي الريبي بشكل كامل في الفيديو أدناه من Nature Video.

المحتوى # 1692018. كل الحقوق محفوظة.
تاريخ آخر تعديل: 2 فبراير 2018.
تم إنشاؤها بواسطة واين دبليو لامورت ، دكتوراه في الطب ، دكتوراه ، MPH ،


في جينوم حقيقيات النوى ، تميل الجينات ذات الوظائف المماثلة إلى التوطين المشترك على مقربة. تشكل مجموعات الجينات هذه جنبًا إلى جنب مع الجينات غير العنقودية مجال كروماتين وهو وحدة تنظيمية ذات ترتيب أعلى. على مستوى أقل ، يتم تنظيم الجينات المعبر عنها بشكل مشترك من خلال النشاط التفاضلي لعوامل النسخ (TF). قارنا التوزيعات على مستوى الجينوم لـ TF في مجموعات الجينات في جينومات ذبابة الفاكهة سوداء البطن و نبات الأرابيدوبسيس thaliana. كشف هذا عن وجود فائض كبير في جينات TF في مجموعات الجينات من أرابيدوبسيس الجينوم ، بينما في جينوم ذبابة الفاكهة لم يختلف توزيع TF في مجموعات الجينات عن العشوائية. نتوقع أن تؤدي هذه البدائل إلى مسارات مختلفة لتنظيم الجينات العنقودية في نوعين وإلى تغييرات تطورية تقدمية في بنية الشبكات التنظيمية ، التي تحكم نشاط الجينات العنقودية في المملكة الحيوانية.

يسلط الضوء

جينومات أرابيدوبسيس و ذبابة الفاكهة. ► مجموعات من الجينات النسبية وظيفيا. عوامل النسخ (TF) في العناقيد الجينية. ► لا يوجد TF في ذبابة الفاكهة مجموعات مقارنة ب أرابيدوبسيس عناقيد المجموعات. ► يقترح آليات تنظيمية مختلفة للجينات العنقودية.


تنظيم التعبير الجيني في بدائيات النوى (مع رسم بياني)

(2) تلك التي يتم تصنيعها فقط بعد تحفيز معين. تم تسمية النوع الأول بالتصنيع التأسيسي والأخير سمي بالأنزيمات المحفزة.

عند تحليل مجموعة متنوعة من الإشريكية القولونية التي كانت معيبة لتحريض اللاكتوز باستخدام الإنزيمات ، قام جاكوب ومونود بالبحث عن الآلية الجزيئية المحتملة التي تتحكم في قمع وإلغاء قمع مجموعة من الجينات. تتطلب الإشريكية القولونية مجموعة من ثلاثة جينات لتكون قادرة على استقلاب اللاكتوز. عند إضافة القليل من اللاكتوز إلى وسط نمو خالٍ من الجلوكوز ، يُلاحظ أن هذه الجينات الثلاثة التي تستخدم اللاكتوز (جينات اللاكتوز) المسماة lac z و lac y و lac a يتم تصنيعها في وقت واحد.

منتج lac z هو إنزيم β-gaIactosidase الذي يحفز تحويل اللاكتوز إلى جالاكتوز وجلوكوز. يتم التعبير عن هذه الجينات في غياب اللاكتوز. اقترح جاكوب ومونود (1961) نموذج الأوبرا لشرح الأساس الجيني لتحريض وقمع جينات اللاك في بدائيات النوى. حصلوا على جائزة نوبل لهذا العمل في عام 1965.

الاوبرون:

1. العمليات هي أجزاء من المادة الوراثية (DNA) تعمل كوحدة منظمة يمكن تشغيلها أو إيقاف تشغيلها.

2. يتكون المشغل من أربعة أنواع على الأقل من الجينات: المنظم ، والمشغل ، والمحفز والهيكلية (الشكل 8.4.A).

3. الجين المنظم هو الجين الذي يشكل مادة كيميائية حيوية لقمع نشاط الجين المشغل.

4. جين المشغل هو جين يتلقى منتج الجين المنظم. يسمح بتشغيل الأوبرون عندما لا يتم تغطيته بواسطة الكيمياء الحيوية التي ينتجها الجين المنظم.

5. يتم إيقاف تشغيل الأوبون عندما يتم تغطية جين المشغل.

6. الجين المحفز هو الجين الذي يوفر نقطة الارتباط ببوليميراز الحمض النووي الريبي المطلوبة لنسخ الجينات الهيكلية.

7. الجينات الهيكلية هي الجينات التي تنسخ mRNA لتخليق عديد الببتيد.

8. قد يكون للأوبرون واحد أو أكثر من الجينات البنيوية ، على سبيل المثال ، 3 في أوبرون لاك ، 5 في أوبرون التربتوفان ، 9 في أوبرون هيستيدين.

9. قد تصبح البولي ببتيدات مكونة من بروتينات هيكلية ، إنزيمات ، بروتينات نقل ، هرمونات ، أجسام مضادة ، إلخ. بعض الجينات الهيكلية أيضًا تشكل رنا غير مشفر.

10. يمكن توضيح آلية تنظيم تخليق البروتين باستخدام نموذج الأوبرا باستخدام مثالين (lac & amp tryptophan) في البكتيريا. & # 8221

نظام التشغيل المحرض (تحريض المشغل):

1. نظام التشغيل المحرض هو (أ) نظام تشغيل منظم حيث تظل الجينات الهيكلية معطلة ما لم وإلى أن يوجد محفز في الوسط. (الشكل 8.4 ب)

2. يحدث في مسارات تقويضية.

3. أوبرون لاك الإشريكية القولونية هو نظام أوبرون محفز اكتشفه جاكوب ومونود (1961).

4. يحتوي أوبرا لاك للإشريكية القولونية على ثلاثة جينات هيكلية ، z و y و a.

5. في الأوبرا المستحث ، تقوم الجينات الهيكلية بنسخ مرنا متعدد الكريات الذي ينتج ثلاثة إنزيمات. هذه هي β-galactosidase و galactoside permease و galactoside acetylase.

6. β-galactoside يؤدي إلى التحلل المائي للاكتوز أو الجالاكتوزيد لتكوين الجلوكوز والجالاكتوز.

7. إن تصريح الجالاكتوزيد مطلوب لدخول اللاكتوز أو الجالاكتوزيد إلى البكتيريا.

8. Galactoside acetylase هو عبارة عن transacetylase يمكنه نقل مجموعة الأسيتيل إلى β-galactoside.

9. كودون البدء للجين الهيكلي z هو TAG (مطابق لـ AUG لـ mRNA) ويقع على بعد 10 أزواج أساسية من نهاية جين المشغل.

10. تسمى المادة التي تؤدي إضافتها إلى تكوين الإنزيم المحرض.

11. المحرض هو مادة كيميائية تلتصق بالقمع وتغير شكل موقع ربط المشغل بحيث لا يبقى القامع مرتبطًا بالمشغل.

12. في lac operon ، يعتبر اللاكتوز هو المحفز الفعلي بينما اللاكتوز هو المحفز الظاهر (المرئي).

13. تسمى المحرضات التي تحفز تخليق الإنزيم دون أن يتم استقلابه بالمحفزات غير المبررة ، على سبيل المثال IPTG (إيزوبروبيل ثيوجالاكتوزيد).

14. ينتج الجين المنظم (الجين) mRNA الذي يصنع مثبطًا كيميائيًا حيويًا.

15. الكابت هو بروتين صغير يتكون من الجين المنظم الذي يرتبط بجين المشغل ويمنع الإنزيم الهيكلي وبالتالي يتحقق من تخليق الرنا المرسال.

16.مثبط lac operon هو بروتين رباعي النواة له وزن جزيئي قدره 1 ، 60000. وهي مكونة من 4 وحدات فرعية لكل منها وزن جزيئي يصل إلى 40000.

17. يحتوي البروتين المثبط على موقعين ، رأس للربط بجين المشغل وأخدود لربط المحفز.

18. يعمل الجين المروج كنقطة التعرف على بوليميراز الحمض النووي الريبي. يرتبط بوليميراز الحمض النووي الريبي في البداية بهذا الجين. تصبح وظيفية فقط عندما تكون قادرة على تمرير جين المشغل والوصول إلى الجينات الهيكلية.

19. يتحكم جين المشغل في التعبير عن المشغل. عادة ما يتم إيقاف تشغيله بسبب ارتباط القامع فوقه.

20. ومع ذلك ، إذا تم سحب المثبط بواسطة المحرض ، فإن الجين يسمح لبوليميراز الحمض النووي الريبي بالانتقال من الجين المحفز إلى الجين البنيوي.

21. في lac operon ، يكون جين المشغل صغيرًا ، طوله 27 زوجًا أساسيًا. يتكون الجين من متواليات متناظرة أو ذاتية التكامل.

22. إذا تمت إضافة اللاكتوز ، فإن المكبِط يصبح غير نشط بحيث لا يمكن ربطه بجين المشغل ويحدث تخليق mRNA.

23. النسخ تحت السيطرة السلبية عندما يتم تعطيل lac repressor بواسطة المحرض.

24. النسخ في lac operon تحت السيطرة الإيجابية من خلال بروتين مستقبل AMP الدوري (CAP).

25. يرتبط بروتين المنشط الجيني catabolite (Cga protein) أو بروتين مستقبل AMP الدوري (CAP) بموقع Cga.

26. عندما يتم إرفاق CAP بموقع الربط ، يصبح المروج أقوى.

27. CAP يعلق فقط على موقع الربط عندما يرتبط مع cAMP.

28. عندما يكون مستوى الجلوكوز مرتفعًا ، لا يحدث cAMP وبالتالي لا يرتبط CAP وبالتالي لا يرتبط بوليميراز الحمض النووي الريبي ، مما يؤدي إلى انخفاض النسخ.

29. لن يظل Lac operon ساري المفعول إلى أجل غير مسمى على الرغم من وجود اللاكتوز في البيئة الخارجية.

30. يوقف نشاطه مع تراكم الجلوكوز والجلاكتوز في الخلية بما يتجاوز قدرة البكتيريا على التمثيل الغذائي.

نظام الأوبرا القابل للقمع (قمع المشغل على سبيل المثال أوبرا تريبتوفان للإشريكية القولونية):

1. نظام التشغيل القابل للقمع هو جزء منظم من المادة الجينية التي تظل عاملة بشكل طبيعي ولكن يمكن إيقاف تشغيلها عندما يكون منتجها إما غير مطلوب أو يتجاوز قيمة حدية.

2. يوجد هذا النظام بشكل شائع في مسارات الابتنائية.

3. مشغل التربتوفان للإشريكية القولونية هو أحد أنظمة التشغيل القابلة للقمع. (الشكل 8.5).

4. يحتوي مشغل التربتوفان على 5 جينات هيكلية & # 8211 E و D و C و B A.

5. الجين E و D لترميز إنزيم anthranilate synthetase ، الجين C لمركب فوسفات الجلسرين ، الجين B للوحدة الفرعية β من التربتوفان المركب و A للوحدة الفرعية α لتخليق التربتوفان.

6. ينتج الجين المنظم (trp-R) مادة كيميائية حيوية ، وهي مادة بروتينية بشكل عام ، تسمى aporepressor.

7. Aporepressor وحده غير قادر على منع الجين المشغل بسبب عدم وجود رأس ملزمة. لذلك ، يظل نظام التشغيل قيد التشغيل.

8. يتشكل القامع الكامل فقط عندما ينضم الكابح غير البروتيني إلى الباصات ،

9. Corepressor هو مكون غير بروتيني أو مثبط وهو أيضًا منتج نهائي للتفاعل المحفز بواسطة الإنزيمات المنتجة من خلال نشاط الجينات الهيكلية.

10. يتحد (corepressor) مع aporepressor ويشكل القامع الذي يحجب بعد ذلك جين المشغل لإيقاف تشغيل المشغل.

11. توقف الجينات الهيكلية عن النسخ وتُعرف الظاهرة باسم كبت التغذية المرتدة.

12. Corepressor من أوبرا التربتوفان هو حمض أميني التربتوفان.

13. في التربتوفان ، لا يكون الجين المثبط مجاورًا للمحفز ولكنه يقع في جزء آخر من جينوم الإشريكية القولونية.

16. الجين المروج (trp-P) هو التعرف وكذلك نقطة البدء لبوليميراز الحمض النووي الريبي. يرتبط بوليميراز الحمض النووي الريبي بجين المروج. يمكن أن ينتقل إلى الجينات الهيكلية بشرط أن يكون جين المشغل في الحالة الوظيفية.

17. يكمن جين المشغل (trp-O) في الطريق بين الجينات المحفزة والجينات البنيوية. عادة يظل قيد التشغيل بحيث يمكن أن ينتقل بوليميراز الحمض النووي الريبي من الجين المحفز إلى الجين البنيوي ويحدث النسخ.

18. يمكن إيقاف تشغيل جين المشغل عندما يتحد كل من الضاغط والضاغط معًا لتشكيل المكبِط. يرتبط المثبط بجين المشغل لمقاطعة حركة بوليميراز الحمض النووي الريبي.

19. في غياب التربتوفان ، يرتبط بوليميراز الحمض النووي الريبي بموقع المشغل وبالتالي يتم نسخ الجينات الهيكلية.

20. يؤدي نسخ الجين الهيكلي إلى إنتاج إنزيم (مركب التربتوفان) الذي يصنع التربتوفان.

21. عندما يتوفر التربتوفان ، لا تكون هناك حاجة إلى إنزيمات تخليق التربتوفان ، حيث يقوم القامع المشترك (التربتوفان) & # 8211 المثبط المعقد بحظر النسخ.

22. أحد عناصر أوبرا التربتوفان هو التسلسل الرئيسي & # 8216L & # 8217 والذي يكون على الفور 5 & # 8242 نهاية trp. الجين E.

23. هذا التسلسل & # 8216L & # 8217 يتحكم في التعبير عن المشغل من خلال عملية تسمى التوهين.

24. التوهين هو إنهاء النسخ المبكر في المنطقة القيادية.

25. عامل التربتوفان هو عنصر تحكم سلبي.

يمكن تلخيص نموذجي الأوبرا الموصوفين أعلاه على النحو الوارد أدناه:

Active Repressor + عامل تشغيل → إيقاف تشغيل النظام

المانع النشط + المحرض = القامع غير النشط ← تشغيل النظام

(2) النظام القابل للقمع:

مجمع Apo-repressor و co-repressor = Active repressor → System OFF

Apo-repressor = Inactive Repressor → تشغيل النظام

أهمية تنظيم الجينات:

1. هناك نوعان من الفعل الجيني & # 8211 التأسيسي والمنظم.

2. يحدث عمل الجين التأسيسي في تلك الأنظمة التي تعمل طوال الوقت ولا تستطيع الخلية العيش بدونها ، على سبيل المثال ، تحلل السكر. لا يتطلب القمع. لذلك ، لا ترتبط جينات المنظم والمشغل به.

3. في عمل الجين المنظم ، يمكن تشغيل أو إيقاف تشغيل جميع الجينات المطلوبة للتفاعل متعدد الخطوات في وقت واحد.

4. يتم تشغيل الجينات أو إيقاف تشغيلها استجابةً لمواد كيميائية معينة سواء كانت مطلوبة لعملية التمثيل الغذائي أو تكونت في نهاية مسار التمثيل الغذائي.

5. التنظيم الجيني ضروري لنمو الخلايا وتقسيمها وتمايزها. يؤدي إلى التشكل.


لماذا النواة مهمة جدا؟

من بين جميع العضيات حقيقية النواة ، ربما تكون النواة هي الأكثر أهمية. في الواقع ، يعتبر مجرد وجود النواة أحد السمات المميزة للخلية حقيقية النواة. هذا الهيكل مهم للغاية لأنه الموقع الذي يوجد فيه الحمض النووي للخلية وتبدأ عملية تفسيره.

تذكر أن الحمض النووي يحتوي على المعلومات المطلوبة لبناء البروتينات الخلوية. في الخلايا حقيقية النواة ، يُطلق على الغشاء المحيط بالنواة & # 8212 عادةً اسم المغلف النووي & # 8212 يقسم هذا الحمض النووي من آلية تصنيع البروتين في الخلية ، والتي تقع في السيتوبلازم. المسام الصغيرة في الغلاف النووي ، ودعا المسام النووية، ثم يسمح انتقائيًا لبعض الجزيئات الكبيرة بالدخول والخروج من النواة & # 8212 بما في ذلك جزيئات الحمض النووي الريبي التي تنقل المعلومات من الحمض النووي الخلوي إلى مراكز تصنيع البروتين في السيتوبلازم. يوفر هذا الفصل للحمض النووي عن آلية تخليق البروتين للخلايا حقيقية النواة تحكمًا تنظيميًا أكثر تعقيدًا على إنتاج البروتينات ووسائط RNA الخاصة بها.

في المقابل ، يتم توزيع الحمض النووي للخلايا بدائية النواة بشكل فضفاض حول السيتوبلازم ، جنبًا إلى جنب مع آلية تخليق البروتين. يسمح هذا التقارب للخلايا بدائية النواة بالاستجابة بسرعة للتغير البيئي عن طريق التغيير السريع في أنواع وكمية البروتينات التي تصنعها. لاحظ أن الخلايا حقيقية النواة قد تطورت على الأرجح من علاقة تكافلية بين خليتين بدائية النواة ، حيث انفصلت مجموعة واحدة من الحمض النووي بدائية النواة في النهاية بواسطة غلاف نووي وشكلت نواة. بمرور الوقت ، قد تكون أجزاء من الحمض النووي من بدائيات النوى الأخرى المتبقية في الجزء السيتوبلازمي من الخلية قد تكون أو لا تكون محتجزة في نواة حقيقية النواة الجديدة (الشكل 3).


برنامج الخلية الافتراضية

كنت طالبًا جامعيًا أدرس الهندسة الميكانيكية مع طلاب ثانويين في الرياضيات والكيمياء وعلوم الكمبيوتر في جامعة بريغهام يونغ في بروفو بولاية يوتا. انضممت إلى مجموعة Gunawardena بصفتي Systems Biology USRI في صيف 2011 ، بدعم من NSF 0856285. عملت مع Tathagata Dasgupta على مقارنة بين تقنيات إعادة بناء الشبكة / الهندسة العكسية المختلفة مع التركيز على مناهج Bayesian وكنت مؤلفًا مشاركًا في الورقة التي قدمناها انظر ملصقي على هذا. أنا مهتم على نطاق واسع بنظرية التحكم ، والتعلم الآلي ، وتحويل الإشارات ، والنمذجة الرياضية للأنظمة البيولوجية ، واستخدام الأساليب الهندسية لتوضيح الأنظمة البيولوجية. مانشستر يونايتد ، فريق كرة القدم المفضل لدي ، زار بوسطن أثناء وجودي هنا. هذا وحده يجعل بوسطن رائعة. أنا حاليًا مساعد باحث في NECSI في بوسطن.

آخر تحديث في 8 أغسطس 2012

ديبيش أغاروال

أنا زميل ما بعد الدكتوراه أعمل في مختبر جيريمي في مشروع تعاوني مع مختبر جاليت لاهاف في HMS ومختبر نيل كيلير في جامعة نورث وسترن. نحن ندعو إلى معالجة المعلومات عن طريق التعديل اللاحق للترجمة (PTM) مع التركيز بشكل خاص على p53 PTM. أقوم بتطوير خوارزميات بناءً على البرمجة الخطية وأخذ عينات موحدة لتحليل بيانات قياس الطيف الكتلي من أعلى إلى أسفل ومن أسفل إلى أعلى لـ p53 في حالات خلوية مختلفة. الهدف العام من هذا المشروع هو تحديد ما إذا كان هناك بالفعل رمز PTM الذي يشفر الحالة الخلوية ثم يتم فك تشفيره أو قراءته لتنشيط مسارات معينة في اتجاه مجرى النهر.

لقد حصلت على درجة في الهندسة (برنامج درجة مزدوجة - البكالوريوس والماجستير) في الهندسة الكيميائية الحيوية والتكنولوجيا الحيوية في IIT دلهي ، الهند حيث كان لدي أيضًا خبرة عملية في بعض تقنيات wetlab. ومع ذلك ، كنت مهتمًا بتطبيق الرياضيات وعلوم الكمبيوتر للحصول على نظرة ثاقبة لعمل الأنظمة البيولوجية. ثم تابعت بعد ذلك للحصول على درجة الماجستير لمدة عام واحد في علم الأحياء الحسابي والطب الحيوي في Polytech Sophia Antipolis ، فرنسا. تبعتها درجة الدكتوراه في INRIA ، صوفيا أنتيبوليس مع فريدريك كازالس ، حيث أجريت تحقيقات خوارزمية لهيكل مجموعات البروتين الكبيرة باستخدام مقياس الطيف الكتلي الأصلي من أعلى إلى أسفل (PMID 25850436).

آخر تحديث في 1 سبتمبر 2016

ناتالي أندرو

طورت ناتالي أجهزة ميكروفلويديك لتنفيذ بروتوكولات تحفيز الإشارات المعقدة في تعاون ترعاه مؤسسة العلوم الوطنية مع تود ثورسن وسامان أماراسينجي في معهد ماساتشوستس للتكنولوجيا. أحد أجهزتها موصوف في ورقة مؤتمر. استخدمت هذه لاحقًا لتطوير طريقة "الاستجواب الخلوي" وهي مؤلفة أول مشاركة في الورقة التي تم تقديمها مؤخرًا حول هذا الموضوع.

آخر تحديث في 11 أغسطس 2013

أدفيت أثريا

طالب بحث UG
عثرية في u.rochester.edu

أنا طالبة في السنة الأخيرة بجامعة روتشستر ، أدرس علم الوراثة الجزيئية والرياضيات التطبيقية. في روتشستر ، أعمل في مختبر الشيخوخة باستخدام تقنيات المختبر الرطب مثل زراعة خلايا الثدييات والمقايسات البيوكيميائية لدراسة LINE1 retrotransposons. خلال الصيف بين السنة الإعدادية والسنة الأولى ، أردت استكشاف الجانب الرياضي لأبحاث علم الأحياء في مختبر Gunawardena. عملت مع Rosa Martinez-Corral و Pencho Yordanov و Ugur Cetiner على دراسة الديناميكيات العابرة لتنظيم الجينات باستخدام الإطار الخطي الذي تم تطويره مسبقًا في المختبر ، انظر ملصقي على هذا.

آخر تحديث في 14 سبتمبر 2019

كايل باسك

تخرجت من جامعة هارفارد بدرجة A.B. في العلوم البيوكيميائية في عام 2008. بعد ذلك ، التحقت بكلية الطب في جامعة نورث وسترن ، وحصلت على دكتوراه في الطب في عام 2012. أنا الآن أتابع تدريب الإقامة في مجال الأشعة في مركز الحالة الطبي بمستشفيات الجامعة في كليفلاند ، أوهايو. في مختبر جيريمي ، عملت أولاً على النمذجة الرياضية لتذبذبات الكالسيوم داخل الخلايا. بعد ذلك ، بالنسبة لأطروحة مرتبة الشرف العليا ، قمت بدراسة التباين من خلية إلى أخرى في أحداث الفسفرة في سلسلة MAPK. كان يجب أن تكون الأجزاء المفضلة من العيش في بوسطن هي المشهد الفني المذهل ، والريد سوكس ، ولهجة نيو إنجلاند. يوما ما آمل بالتأكيد أن أعود.

آخر تحديث في 8 أغسطس 2012

اشوين بولا

أنا طالب جامعي في IIT دلهي في قسم الهندسة الكيميائية. يركز بحثي مع مجموعة Gunawardena على تقييم جدوى بعض ظواهر تنظيم الجينات مثل التحميل المساعد من وجهة نظر الديناميكا الحرارية. أنا مهتم بشكل خاص بفهم كيف يمكن لعوامل النسخ إعادة تشكيل الكروماتين بحيث يساعد عاملا النسخ اللذان يرتبطان بنفس الموقع على منطقة الكروماتين بعضهما البعض في الارتباط بمنطقة المروج بدلاً من التنافس مع بعضهما البعض. لمعرفة ما إذا كان هذا يحدث عند التوازن أو بعيدًا عنه ، فأنا أستخدم إطار العمل الخطي لنمذجة النظام رياضيًا ثم محاكاة هذا النموذج ضمن النطاق الواقعي للمعلمات لمعرفة التحسينات التي يمكن لكل من TFs توفيرها لبعضها البعض دون إنفاق الطاقة . لذا فإن الأسئلة الأساسية التي أحاول النظر إليها هي: ما مقدار المساعدة التي يمكننا تحقيقها عند التوازن؟ كيف تؤثر التعاونيات النمطية وغير المتجانسة على هذه الظاهرة؟ هل التغيير في التشكل مع الاختلافات الملزمة ينتج عنه أي اختلاف كبير في المساعدة؟

آخر تحديث في 12 يوليو 2017

جون بيدل

أجريت بحثًا لدرجة الدكتوراه في الفيزياء النظرية في جامعة ميريلاند ، مع التركيز على الديناميكا الحرارية والميكانيكا الإحصائية ، وخاصة دراسة انتقالات الطور والحالات غير المستقرة. تم توجيه رسالتي بواسطة ميخائيل أنيسيموف حول موضوع الانحرافات الديناميكية الحرارية في المياه فائقة التبريد.

من المعروف أن التعبير الجيني في حقيقيات النوى يحدث بعيدًا عن التوازن الديناميكي الحراري. ومع ذلك ، فإن النماذج المستخدمة لوصف تنظيم الجينات حقيقية النواة مشتقة حتى الآن من فهمنا بدائيات النوى ، حيث يحدث التعبير الجيني عند التوازن. يهدف بحثي في ​​مختبر Gunawardena إلى تحسين فهمنا لتنظيم الجينات حقيقية النواة من خلال مراعاة التأثيرات غير المتوازنة.

آخر تحديث في 1 سبتمبر 2016

فيليكس بونوفسكي

طالب بحث UG
فيليكس في Bonowski.de

كتب فيليكس وحدة عامة لاللتقام الخلوي للمستقبلات وإعادة التدوير والتدهور في ب

آخر تحديث في 19 مايو 2006

فريدريك تشانغ

مساعد باحث
frdchang في gmail.com

درست الهندسة الكهربائية وعلوم الكمبيوتر في جامعة كاليفورنيا في بيركلي مع التركيز على الروبوتات ، حيث استمتعت بشكل خاص بممارسة تحويل الطاقة الحرة إلى الحساب والحركة. تضمنت تجربتي البحثية السابقة فهم فيزياء الأحداث النادرة في الكيمياء الحاسوبية مع Jhih-Wei Chu واستكشاف إشارات الكالسيوم في خلايا الثدييات باستخدام الموائع الدقيقة مع Jeremy Gunawardena. أنا الآن مرشح لنيل درجة الدكتوراه في السنة الثانية من EPB من خلال قسم بيولوجيا الخلايا الجزيئية وطالب في نانسي كليكنر. يتم استنزاف الجزء الأكبر من مخيلتي حاليًا من خلال السؤال عن كيفية تنفيذ الكروموسومات للبحث في إعادة التركيب المتماثل. الشيء المفضل لدي في بوسطن هو ركوب الدراجات إلى والدن بوند ، ثم تناول هوت دوج باهظ الثمن بجانب الموقف في ساحة انتظار السيارات.

آخر تحديث في 8 أغسطس 2012

أرهانا تشاتوبادياي

أنا حاليًا طالب طب في جامعة ستانفورد. قضيت 3 سنوات في مختبر Gunawardena بينما كنت طالبًا جامعيًا في جامعة هارفارد أدرس البيولوجيا الكيميائية والفيزيائية. عملت مع ناتالي أندرو وفريد ​​تشانغ على استخدام الموائع الدقيقة لدراسة أسئلة رائعة في بيولوجيا الأنظمة. لقد أجريت أطروحة عليا في المختبر باستخدام أجهزة ميكروفلويديك لدراسة كيفية ذلك ديسكويستيليوم ديسكويديوم، وهو قالب طين يعمل كنموذج لهجرة الخلايا حقيقية النواة ، ويستجيب للإشارات الكيميائية والميكانيكية. تم منح رسالتي ، المتوفرة هنا ، جائزة توماس تي هوبس من جامعة هارفارد في عام 2011. أنا مهتم على نطاق واسع بالهندسة على نطاق صغير ، والميكانيكا الخلوية ، والجراحة ، والعلوم في البلدان النامية.

آخر تحديث في 30 ديسمبر 2013

فرجينيا كوبر

أنا متخصص في الكيمياء / البيولوجيا في جامعة هوارد. تكمن خلفيتي البحثية في الكيمياء العضوية الاصطناعية ، وتوليف نظائر حمض الغاليك المضاد للأكسدة لتعزيز خصائصه المضادة للالتهابات والمضادة للطفرات والمضادة للسرطان. كنت من USRI لبيولوجيا الأنظمة في مختبر Gunawardena في صيف عام 2012 بدعم من NSF 0856285. لقد عملت مع Sudhakaran لدراسة أنشطة الفسفرة الذاتية لأشكال الفسفون الجزئية من Erk ، انظر إلى ملصقي على هذا. كانت الأجزاء المفضلة لدي في بوسطن هي تنوع الأطعمة والتاريخ والثقافة. أوصي أيضًا برحلة إلى كيب كود إن أمكن.

آخر تحديث في 13 أغسطس 2012

شريبريا داس

أنا زميل أبحاث ما بعد الدكتوراه في مختبر Gunawardena في قسم بيولوجيا الأنظمة ، كلية الطب بجامعة هارفارد. حصلت على درجة الدكتوراه من قسم الهندسة الكهربائية وهندسة الحاسبات في جامعة تكساس في أوستن تحت إشراف الدكتور هاريس فيكالو. قبل ذلك ، أكملت بكالوريوس الهندسة في الإلكترونيات وهندسة الاتصالات الكهربائية من المعهد الهندي للتكنولوجيا ، خراجبور. تتركز اهتماماتي البحثية على نطاق واسع في بيولوجيا الأنظمة ومعالجة الإشارات والتعلم الآلي. يمكن العثور على مزيد من المعلومات على موقع الويب الخاص بي.

آخر تحديث في 6 سبتمبر 2017

تاتاجاتا داسغوبتا

لقد حصلت على درجة الدكتوراه في نظرية الأوتار من جامعة كامبريدج. في مختبر Gunawardena ، شاركت في تطبيق وتطوير تقنيات رياضية وإحصائية وحسابية لتعلم تعقيدات الأنظمة الحية. تمتد مشاريع الأمثلة من نهج الهندسة الجبرية الحسابية في سياق تنظيم تحلل السكر في الثدييات (PMID 24634222) إلى استخدام أساليب التعلم الآلي في المجال الناشئ من "علم الأمراض الحسابي" (PMID 26553024). يتضمن الاتجاه الأخير العمل عن كثب بالتعاون مع الأطباء لبناء نماذج تنبؤية باستخدام ملف المناعة المكروية البيئية في سياقات مختلفة للتكاثر البشري والسرطان.

آخر تحديث في 5 سبتمبر 2016

جوزيف دكستر

طالب دكتوراه
jdexter في برينستون

أنا طالب جامعي في جامعة برينستون في قسم الكيمياء ومعهد لويس سيجلر لعلم الجينوم التكاملي. يركز بحثي مع مجموعة Gunawardena على تطوير نماذج رياضية واقعية كيميائيًا حيويًا لشبكات التمثيل الغذائي والإشارات المهمة. أنا مهتم بشكل خاص بفهم كيفية تنفيذ السلوك القوي في الأنظمة البيولوجية من خلال ميزات جزيئية محددة مثل الوظائف الأنزيمية المتعددة و oligomerization. تسعى نماذجي جاهدة لالتقاط التفاصيل البيوكيميائية الأساسية والاستفادة المكثفة من التقنيات الهندسية الجبرية التي طورتها مجموعة Gunawardena لتمكين التحليل. في برينستون ، أعمل أيضًا على تطبيق الموائع الدقيقة على مجموعة متنوعة من المشكلات في بيولوجيا الأنظمة والفيزياء الحيوية. أنا خريج نشط في معهد العلوم البحثية وقمت بالتدريس في البرنامج في الصيفين الماضيين. خارج العلم ، أنا طالب في الكلاسيكيات ، حيث تركز أبحاثي في ​​الغالب على المسرح القديم وكيف أثر الأدب الكلاسيكي على الاهتمامات الأدبية والثقافية الحديثة.

آخر تحديث في 8 أغسطس 2012

ستيفانو دي بريتيس

أنا طالب دكتوراه في المعلوماتية الحيوية في "Universit & agrave degli studi di Milano-Bicocca" والموضوع الرئيسي لبحثي هو حول ما إذا كانت شبكات تفاعل كيميائية معينة تعرض ثباتية أم لا.على وجه الخصوص ، أنا مهتم بـ CRNT (نظرية شبكة التفاعل الكيميائي) وفي الظروف التي تقود الشبكة إلى الاعتراف بالثباتية. في مختبر Gunawardena ، أقوم بتطبيق دراساتي النظرية على شبكة "حقيقية": نموذج أساسي لتمايز الخلايا الجذعية الجنينية. أقوم بصياغة ورقة حول هذا ، بالإضافة إلى إنهاء أطروحة الدكتوراه الخاصة بي. أصبحت أكثر خبرة في دمج العمل الحسابي والنظري مع التجارب. إنها فرصة رائعة بالنسبة لي للعمل مع أشخاص لديهم خلفية رياضية يتم استخدامها للتعامل مع تجارب حقيقية وبيانات بيولوجية. آمل أن أتمكن من التعاون بشكل مباشر أيضًا مع المجرب الحقيقي لأنني أعتقد أن الهدف العظيم لبيولوجيا الأنظمة يكمن في التأثير المباشر بين النظرية والتجارب ، من أجل بناء نماذج واقعية لما يحدث بالفعل في الخلية. أنا مهتم بالموسيقى والرياضة والتصوير. رياضتي المفضلة هي كرة القدم (التي يتم لعبها ومشاهدتها) ولكن هنا في بوسطن أشارك في جميع الألعاب الرياضية الشائعة هنا ، وخاصة لعبة البيسبول. بوسطن مدينة جميلة للغاية ، حيث يمكنك أن تجد اندماجًا بين الثقافة الأوروبية والأمريكية. إنني أقدر كامبردج كثيرًا بسبب الحيوية التي يجلبها العديد من الطلاب هناك إلى المدينة.

آخر تحديث في 13 أغسطس 2012

بيانكا دوميتراسكو

منذ المدرسة الثانوية قررت أن الرياضيات هي السبيل للذهاب. إنه يتعلق بالاتصالات ، حول الهيكل ، حول الإبداع. أنا حاليًا طالب صاعد يدرس الرياضيات التطبيقية في معهد ماساتشوستس للتكنولوجيا. لقد كنت أعمل خلال العام الماضي في مختبر البروفيسور بوني بيرجر في علم الأيض ، وتوقع بنية الحمض النووي الريبي ، ومعظم شبكات تفاعل البروتين حاليًا. اهتماماتي البحثية موجهة حاليًا نحو البيولوجيا الحاسوبية وبيولوجيا الأنظمة ، لكنني مهتم أيضًا بأجزاء مختلفة من علوم الكمبيوتر النظرية. عادة ما أواجه مشاكل في الإجابة على السؤال "وماذا تفعل من أجل المتعة؟" لأن كل الأشياء التي أقوم بها ممتعة للغاية. ومع ذلك ، يمكنني القول أنني أكتب من أجل المتعة. أنا مهتم بجميع أشكال الفن وجميع أشكال الأدب ، ولدي إعجاب خاص بأي شيء يتعلق بالأنثروبولوجيا الاجتماعية وتاريخ الدين. الشيء المفضل لدي في بوسطن: هواءها الأوروبي الذي ذكرني بالوطن. أقول "تم التذكير" لأنه يمكنني بسهولة تسميته بالمنزل الآن. في صيف عام 2011 ، كنت عضوًا في Systems Biology USRI في مختبر Gunawardena ، بدعم من NSF 0856285. عملت مع Bobby Karp على نموذج لإشارة Wnt في خلايا الثدييات ، انظر إلى ملصقي على هذا. لقد استمتعت بالعمل مع الجميع. أحب القصص وخلال الصيف أتيحت لي الفرصة لمقابلة أشخاص رائعين وسماع قصصهم الرائعة. مجموعة Sys Bio هي بيئة تعليمية لا تصدق ، وأنا أتطلع إلى مواصلة العمل الذي بدأته خلال الصيف.

آخر تحديث في 8 أغسطس 2012

روزين دوشيم

أنا طالبة صاعدة في كلية سبيلمان أدرس الكيمياء الحيوية مع تخصص فرعي في الرياضيات. خلفيتي البحثية هي الكيمياء الحيوية ، التحليل الجزيئي لـ Dibenzoylmethane في خلايا سرطان البروستاتا المقاومة للأندروجين. انضممت إلى مجموعة Gunawardena في صيف 2013 ، بصفتي Systems Biology USRI بدعم من NSF 0856285. أنا أعمل مع Tathagata Dasgupta على تحديد وتوصيف الوظائف الثنائية في Escherichia coli باستخدام الأساليب الحسابية ، انظر ملصقي على هذا. لقد مررت بتجربة رائعة في بوسطن ، فهي تشبه إلى حد بعيد المدن الأوروبية ذات الثقافة والتاريخ العظيمين.

آخر تحديث في 11 أغسطس 2013

Enciso ألماني

كان عملي في رسالتي في الرياضيات ، ودرس تأثير التغذية الراجعة الإيجابية والسلبية على سلوك الأنظمة الديناميكية في سياق مجرد. لقد قمت بتطبيق هذا العمل على نماذج التفاعلات الكيميائية الحيوية وأنظمة انتشار التفاعل ، وقمت ببعض النمذجة للعصبونات الداخلية في الشبكية. في مختبر جيريمي ، أقوم بتطوير وحدات عامة للتفاعلات البيوكيميائية في الجزء الصغير b وسأستخدمها لدراسة مسارات نقل الإشارات المرتبطة بمستقبلات EGF. أنا حاليًا أستاذ مساعد في جامعة كاليفورنيا في إيرفين.

آخر تحديث في 28 أكتوبر 2009

خافيير استرادا

زميل ما بعد الدكتوراه
جيسترادا في hms.harvard.edu

كنت باحثًا مشتركًا في مرحلة ما بعد الدكتوراة بين مختبرات Gunawardena و DePace من 2013 إلى 2017. خلال تلك الفترة أثبتنا كيف يمكن تفسير النسخ في الحيوانات فقط بافتراض تبديد الطاقة و / أو التفاعل المعقد بين عوامل النسخ ومنظمها ، وهي خطوة أساسية نحو فهم مثل هذا عملية مركزية في علم الأحياء (PMID 27368104). منذ عام 2017 أنا باحث في معاهد نوفارتيس للأبحاث الطبية الحيوية أعمل في علم الأورام المناعي. هناك ، نحاول الإجابة على أسئلة رئيسية مثل: كيف يتصرف الجهاز المناعي في البيئة الدقيقة للورم؟ كيف يتم التفاعل بين الخلايا السرطانية والخلايا الليمفاوية؟ كيف يعمل الضغط التطوري على تشكيل الأورام لجعلها مقاومة للأدوية والجهاز المناعي؟ هل يمكننا استخدام كل هذه المعرفة لتطوير عقاقير أفضل وأكثر كفاءة؟

لقد تدربت كطبيب فيزيائي في Universidad Aut & oacutenoma de Madrid ، إسبانيا ، وعملت سابقًا مع مختبر Gunawardena في "الاستجواب الخلوي" (PMID 27367445).

آخر تحديث في 12 يونيو 2018

روكسانا فيير

أنا طالبة صاعدة في جامعة هارفارد وأتخصص في الرياضيات مع تخصص ثانوي في الفيزياء الفلكية. على الرغم من أن معظم دوراتي الجامعية كانت في الرياضيات البحتة ، فقد أصبحت مؤخرًا أكثر اهتمامًا بنظيراتها التطبيقية. كان هذا التغيير في الاهتمامات هو ما دفعني إلى علم أحياء الأنظمة لصيف 2011 بصفتي USRI ، بدعم من جائزة كلية هارفارد. يحاول مشروعي ، الذي يعمل مع بوبي كارب ، وضع نماذج للأنظمة البيولوجية (خاصة مسار Wnt) من خلال استخدام الأنظمة الديناميكية متعددة الحدود على الحقول المحدودة. يتم ذلك من خلال البناء على الخوارزميات التي تم تطويرها في البداية في سياق الهندسة الجبرية ، لحسابات أساس Grobner. يمكن استخدام هذه النماذج لاستنتاج بنية الشبكة للمسار ، وكذلك لعمل تنبؤات حول الديناميكيات ، انظر إلى ملصق PRIZE الخاص بي على هذا. بصرف النظر عن الاهتمامات الأكاديمية ، فأنا أيضًا مصور فوتوغرافي متعطش (رغم أنه ليس جيدًا بعد). لقد فعلت كل من الأفلام والرقمية ، والمشي لمسافات طويلة في ساحة هارفارد مع الكاميرا الخاصة بي لا يفشل أبدًا في الاسترخاء عندما يصبح العمل المدرسي مرهقًا.

آخر تحديث في 19 أغسطس 2012

Andr & eacutes Fl & oacuterez

أنا طالبة دراسات عليا في المركز الألماني لأبحاث السرطان في هايدلبرغ. أنا أركز على فهم التحكم في نقطة التقييد في دورة الخلية لورم معين للأطفال يسمى الورم الأرومي العصبي. تتمثل الإستراتيجية في الجمع بين التجارب والنمذجة الرياضية لتوضيح الآليات الجزيئية المشاركة في تطور دورة الخلية لهذا المرض. عملت كمتدرب باحث في مختبر Gunawardena في 2009-10 بشكل أساسي من الجانب التجريبي ومحاولة الجمع بين النمذجة الرياضية لفهم إشارات الكالسيوم في سياق عدوى الطفيليات بالتعاون مع الدكتورة باربرا بيرلي من قسم المناعة والأمراض المعدية في كلية هارفارد للصحة العامة. لقد درست أنماط التذبذبات التي يسببها الناهض في الخلايا الليفية والضامة الأولية المصابة وغير المصابة مع طفيلي البروتوزوان ، المثقبية الكروزية. أظهرت النتائج الأولية أن T. cruzi يغير السعة والتأخير الزمني للتذبذبات على الأرجح بواسطة آلية تتوسطها السيتوكين. كانت تجربتي في مختبر Gunawardena مثيرة حقًا حيث تمكنت من رؤية العمل في تجارب العمل والنمذجة معًا لطرح أسئلة ذات مغزى على الخلايا. وبوسطن يجب أن أقول إنها مدينة جميلة ، حيث يمكنك أن تتنفس المعرفة في كل مكان ، بمساعدة المناظر الطبيعية الملهمة. لقد استمتعت كثيرًا بأنشطة رقص السالسا في بوسطن حيث أتيحت لي الفرصة لتعلم أسلوب نيويورك ، والذي يختلف تمامًا عن الأسلوب الكولومبي الذي اعتدت عليه.

آخر تحديث في 8 أغسطس 2012

دانيال جيبسون

جاء دانيال إلينا من كلية كولورادو للمناجم ، في ولايته الأصلية ، حيث أجرى بحثًا في الصوتيات غير الخطية المتعلقة باكتشاف الألغام الأرضية بصفته مساعدًا جامعيًا وباحثًا. كانت شهادته في الفيزياء الهندسية ، مع تخصص ثانوي في الهندسة الحيوية وعلوم الحياة بالإضافة إلى تكنولوجيا الموسيقى. واصل دانيال الجانب الموائع الدقيقة من مشروع إشارات الكالسيوم الذي بدأه ناتالي أندرو وفريد ​​تشانغ ، مما أدى إلى ورقة عام 2016 في PLoS Comput Biol. كما تعاون أيضًا مع مختبر Kat Hadjantonakis في سلون كيترينج لاستخدام أجهزة ميكروفلويديك للمساعدة في تصوير أجنة الفأر. يعمل دانيال حاليًا كعالم بيانات في سان فرانسيسكو.

آخر تحديث في 22 أغسطس 2016

فلوريان جناد

درست المعلوماتية الحيوية في جامعة Ludwig Maximilians (LMU) وفي جامعة Technische Universitaet (TUM) في ميونيخ. في موازاة ذلك ، درست الاقتصاد في LMU. كانت أطروحة الماجستير الخاصة بي حول تحليل بيانات المصفوفات الدقيقة للجينات المتحيزة للجنس في ذبابة الفاكهة السوداء ، والتي من أجلها أنشأت قاعدة بيانات التحيز الجنسي. استنادًا إلى تحليل الجينوم على نطاق واسع وإدارة قاعدة البيانات للجينات المتحيزة جنسياً ، وجدنا أن جينات الذباب المتحيزة للذكور أقل حفظًا من الجينات المتحيزة للإناث. كانت حقيقة أنه يمكن للمرء أن يشتق مثل هذه الأنماط على أساس As و Ts و Cs و Gs رائعة جدًا بالنسبة لي. كان تركيز دراسة الدكتوراه في معهد ماكس بلانك للكيمياء الحيوية على التحليل واسع النطاق وإدارة قواعد البيانات لمواقع الفسفرة المحددة. فسفرة البروتين هي آلية تنظيمية أساسية تتحكم في العديد من عمليات إشارات الخلايا. في هذا السياق ، قمت بإنشاء قاعدة بيانات موقع الفسفرة PHOSIDA. عملت أيضًا على دراسات بروتينية مختلفة وأنشأت قاعدة بيانات البروتين MAPU 2.0. ثم عملت في المعهد الأوروبي للمعلومات الحيوية (EBI) في كامبريدج بالمملكة المتحدة على شرح الجينوم باستخدام بيانات قياس الطيف الكتلي. بعد الانتهاء من الدكتوراه ، بدأت العمل في مجموعة جيريمي جوناواردينا في كلية الطب بجامعة هارفارد. نحن ندرس الحفاظ على الفسفرة متعددة المواقع. إن فكرة نمذجة الخلية الحية إلى جانب عملياتها المعقدة رائعة أيضًا وأنا أخطط لتطوير البنية التحتية للبرمجيات لدعم ذلك.

آخر تحديث في 24 مايو 2009

ناميتا جوبتا

كنت من USRI في علم الأحياء للأنظمة في مجموعة Gunawardena في عام 2010. خلال فترة التدريب ، عملت مع Bobby Karp في مشروع يدرس خصائص الحالة المستقرة للمسارات الجزيئية لمجموعة واسعة من المعلمات. لقد ساعدت في تطوير برنامج يحلل عدد وأنواع الحالات المستقرة في إطار حركية الحركة الجماعية ، باستخدام تقنيات عددية عالية الأداء والهندسة الجبرية ، انظر إلى ملصقي على هذا. لقد استخدمت Python و C ++ و Mathematica ، وتعلمت استمرارية التماثل المتماثل ، والأهم من ذلك فهمت كيف يمكن نمذجة المسارات الكيميائية الحيوية بشكل واقعي ، وكيف ترتبط هذه النماذج بالتجارب الجارية في المختبر. لقد تلقيت بكالوريوس. في الرياضيات التطبيقية وبكالوريوس. في علم الأحياء من جامعة شيكاغو. انا حاليا دكتوراه. مرشح في جامعة ييل في علم الأحياء الحاسوبي والمعلوماتية الحيوية. أقوم حاليًا بالتناوب في المختبرات التي تطور طرقًا حسابية لعلماء الأحياء. الشيء المفضل لدي في بوسطن هو مدى سهولة التجول في المدينة سيرًا على الأقدام في فصل الصيف. أنا أيضًا أحب كيف يوجد توازن كبير بين المساحات الخضراء الممزوجة بالمباني - خاصةً المشتركة!

آخر تحديث في 8 أغسطس 2012

بنيامين جيوري

أنا عالم كمبيوتر ، وحاليا طالبة دكتوراه في جامعة سنغافورة الوطنية. تتركز اهتماماتي البحثية حول الأساليب الحسابية لنمذجة ديناميكيات مسارات الإشارة باستخدام الأساليب الاحتمالية. تسمح لنا النماذج الاحتمالية بمعالجة عدم اليقين في النظم البيولوجية الناشئة عن عوامل مثل العشوائية في العمليات الكيميائية الحيوية ، والتباين بين الخلايا الفردية ، والمكونات غير النموذجية وضوضاء القياس. هدفي هو تقديم حلول فعالة للتحديات التي ينطوي عليها بناء واستخدام مثل هذه النماذج. حاليًا ، أقوم بتطوير طريقة عامة قابلة للتطوير لتعلم شبكات Bayesian الديناميكية ، وتطبيق هذه الطريقة لنمذجة مسارات الإشارات المشاركة في تطور سرطان الكبد.

آخر تحديث في 26 أغسطس 2013

نيكولاس هيلجرت

طالب بحث UG
نيلجيرت في بوردو

أنا طالبة صاعدة في جامعة بوردو وأتدرب في برنامج هارفارد سيستمز بيولوجي لصيف 2019. أنا أدرس الفيزياء والرياضيات ، على الرغم من أنني مهتم بتقاطعاتهم مع علم الأحياء ، مما جذبني إلى هذا المختبر. استعارة أفكارًا من الميكانيكا الإحصائية وعمليات ماركوف ، فأنا أعمل على فهم الظروف التي تنطوي على تجميع مرتب لعوامل النسخ أثناء تنظيم الجينات حقيقية النواة ، انظر إلى الملصق الخاص بي على هذا.

آخر تحديث في 9 سبتمبر 2019

بوبي كارب

انضم بوبي كارب إلى المجموعة في عام 2009 بخلفية في الرياضيات (دكتوراه في الهندسة الجبرية في جامعة ديوك) وفيزياء (دكتوراه من جامعة إيوتفوس في نظرية المجال الكمومي). لقد عمل على مشكلة جغرافيا المعلمات وكان أيضًا المؤلف الأول المشارك لورقتنا البحثية حول الثوابت "المعقدة الخطية". انضم إلى Goldman Sachs في نيويورك عام 2012.

ين دير لي

طالب بحث UG
yenderlimedphy في gmail.com

أنا طالبة طب في السنة الرابعة ولدي تخصص مزدوج في الفيزياء في جامعة تايوان الوطنية. في مجموعة Gunawardena ، كنت أعمل مع Yangqing Xu لاستكشاف كيفية تأثير كثافة الخلية على ERK في إشارة عدم التجانس. يكمن اهتماماتي البحثية في الفيزياء الحيوية وبيولوجيا الأنظمة. إلى جانب البحث ، أنا مهتم أيضًا بصناعة الاستشارات وكذلك ريادة الأعمال الصيدلانية الحيوية.

مارك ليبسون

طالب بحث UG
مارك. ليبسون في gmail.com

قام مارك بعمل أطروحة مع مرتبة الشرف العليا في "النُهج التفاضلية والرسومية للتعددية في شبكات التفاعل الكيميائي" متاح في arxiv.org/abs/0709.0125. حصل على جائزة أصدقاء قسم الرياضيات وجائزة توماس تي هوبس من جامعة هارفارد.

آخر تحديث في 18 يناير 2008

موهان ملشية

زميل ما بعد الدكتوراه
Mohan_malleshaiah في
hms.harvard.edu

أنا مهتم بفهم طبيعة الشبكات الجزيئية وكيفية معالجتها لمعلومات الإشارة "لحساب" قرارات مصير الخلية. تحقيقًا لهذه الغاية ، أستخدم الأساليب التكاملية من خلال الجمع بين القياسات الكمية (على مستوى الخلية الواحدة والسكان) مع التحليل والنمذجة الحسابية. لقد شرحت آليات جديدة لانتقال حالة الخلية في الخميرة الناشئة وكذلك في أنظمة نماذج الخلايا الجذعية متعددة القدرات.

لقد حصلت على درجة الدكتوراه مع البروفيسور ستيفن ميتشنيك في جامعة مونتريال حيث قمت بتحليل ديناميكيات مجمع البروتين داخل الخلايا الحية. لقد قمت بتحليل بروتينات إشارات MAPK لشرح آلية فريدة من نوعها للحساسية الفائقة من الدرجة الصفرية من أجل التبرعم الشبيه بالتبديل إلى قرار التزاوج في خلايا الخميرة (PMID 20400943). شرحت أيضًا كيف تدمج خلايا الخميرة إشارات متعددة في نفس الوقت وترتب أولويات استجابتها عن طريق ضبط الحساسية للإشارات من خلال تفاعلات المسار المتقاطع (PMID 22186894).

بإلهام لشرح مصائر الخلايا في نظام الثدييات شديد التعقيد ، اخترت تحليل الخلايا الجذعية لأبحاث ما بعد الدكتوراه. بصفتي زميلًا في CIHR (المعاهد الكندية للبحوث الصحية) في مختبر البروفيسور جيريمي جوناواردينا ، قمت بتطوير نهج تكاملي لتحليل الخلايا الجذعية الجنينية (ESC). بالتعاون مع مختبر البروفيسور ألفونسو مارتينيز أرياس في جامعة كامبريدج ، طبقت هذا النهج لفهم ديناميكيات شبكة عوامل النسخ (TFs) ذات القدرات المتعددة أثناء تمايز ESCs في مصائر الخلايا البديلة. اكتشفنا أنه تم إعادة تكوين مجموعة فرعية من TFs متعددة القدرات لإنشاء شبكات جديدة تعزز التمايز (PMID 26832399 و Cell Reports ، 2016).

لفهم سلوك الخلايا الجذعية الفردية بشكل أفضل وعدم تجانسها السكاني ، قمت بتطبيق بروتينات أحادية الخلية وطرق حسابية لتحليل البيانات المعقدة. بالتعاون مع معمل البروفيسور جورج دالي. أقوم بتحليل مجموعات الخلايا المتميزة أثناء إعادة برمجة الخلايا الجذعية متعددة القدرات إلى أ) خلايا كاملة القدرة و ب) أسلاف الخلايا الجذعية المكونة للدم.

منشوراتي على NCBI. بعد الانتهاء من زمالة ما بعد الدكتوراه ، انضممت إلى معهد مونتريال للأبحاث السريرية.

أنيل مالافارابو

باحث كبير في العلوم
رئيس مشروع ب الصغير
www.littleb.org

قبل الانضمام إلى قسم بيولوجيا الأنظمة ، أمضيت عدة سنوات في شركة Millennium Pharmaceuticals خلال ذروة علم الجينوم في تطوير التكنولوجيا وقيادة الجهود لدمج وتبادل المعرفة العلمية المنظمة. خلال ذلك الوقت ، أتيحت لي الفرصة لقضاء عام في مركز هارفارد لأبحاث الجينوم لفهم كيف يمكن تطبيق نظرية الأنظمة على مشاكل اكتشاف الأدوية. كانت إحدى المشكلات البارزة هي كيفية تبسيط عملية بناء نماذج موثوقة. تخيلت أداة من شأنها أن تمكن المصمم من "خلط" المكونات المحددة مسبقًا والموثوقة معًا. ستربط هذه الأشياء ببعضها البعض تلقائيًا - على غرار الطريقة التي يعيد بها عالم الكيمياء الحيوية تكوين نظام عن طريق مزج البروتينات في أنبوب اختبار. لقد اقترحت إطارًا حسابيًا يعتمد على هذه الفكرة ، وتطور هذا إلى لغة برمجة صغيرة تعتمد على LISP مصممة لبناء نماذج معيارية قابلة للمشاركة. لا تتردد في الاتصال بي إذا كانت لديك أسئلة حول Little b.

كان تدريبي الرسمي في بيولوجيا الخلية والكيمياء الحيوية ، على الرغم من أنني كنت مهتمًا منذ فترة طويلة بالحوسبة. بدأت دراستي في العلوم مع دان جاي ، الذي كان حينها أستاذًا في جامعة هارفارد بايو لابز. لقد أنشأنا microCALI ، وهي نسخة تعتمد على المجهر لتقنية تعطيل نشاط الليزر بمساعدة الكروموفور والتي كان رائدًا فيها ، واستخدمها لاستكشاف دور الجزيئات في نمو الخلايا العصبية. لقد حصلت على درجة الدكتوراه. في UCSF مع تيم ميتشيسون ، طوروا تقنيات التنشيط الضوئي والتبييض الضوئي لتصور ديناميكيات الهيكل الخلوي المشاركة في: حركة طرف الخلايا العصبية ، والانقسام ، وتوجيه انقسام الخلية.

آخر تحديث في 24 فبراير 2006

أرجون (راج) مانراي

طالب بحث UG
مانراي في fas.harvard.edu

عمل راج على ثوابت الحالة المستقرة للفسفرة متعددة المواقع للفيزياء 90R وهو المؤلف الأول للورقة التي انبثقت عن ذلك. كما عمل مع شركة Enciso الألمانية على ثنائيات مستقبلات EGF. وهو حاليًا طالب دراسات عليا في برنامج Harvard-MIT HST.

آخر تحديث في 28 أكتوبر 2009

إينومزون ميرزاييف

كطالب بحث جامعي في مختبر البروفيسور جوناواردينا ، عملت على الجوانب الديناميكية للإطار الخطي. تم نشر النتائج التي توصلنا إليها لاحقًا في هذه الورقة. لقد استلمت شهادة البكالوريوس. في الرياضيات من جامعة الشرق الأوسط التقنية في أنقرة ، تركيا ودكتوراه في الرياضيات التطبيقية من جامعة كولورادو بولدر. خلال مدرسة الدراسات العليا ، استخدمت تقنيات رياضية مختلفة لدراسة التركيبة القابلة للعكس وفصل الجسيمات المعلقة في سائل. لقد تابعت أيضًا الدراسات السابقة للإطار الخطي (PMID 25795319). بعد التخرج من المدرسة ، حصلت على منصب مشترك لما بعد الدكتوراه مع معهد الرياضيات الحيوية في جامعة ولاية أوهايو وعيادة كليفلاند في كليفلاند ، أوهايو. بصفتي باحثًا في مرحلة ما بعد الدكتوراة ، كنت مهتمًا بتطبيقات التعلم الآلي في التجزئة الآلية للبنى التشريحية من التصوير بالرنين المغناطيسي. يمكن العثور على ملخصات لبعض المشاريع الأخرى التي عملت عليها على صفحة الويب الشخصية الخاصة بي. بعد أن أنهيت دراستي في مرحلة ما بعد الدكتوراه ، انضممت إلى Workday Inc كعالم في التعلم الآلي.

تم التحديث الأخير في 26 نوفمبر 2018

ناندوكومار موهان

نشأت في شارون بولاية ماساتشوستس وتخرجت من مدرسة شارون الثانوية. أنا حاليًا طالب في جامعة ماساتشوستس في أمهيرست. أنا متخصص في علم الأعصاب أشق طريقه من خلال تمهيدي الطب والاستعداد لكلية الطب. لطالما كان العلم نوعًا من النداء بالنسبة لي وكنت أرغب دائمًا في متابعته. في حين أن خلفيتي تتعلق أكثر ببحوث الكيمياء وخبرة مختبر الكيمياء ، مقارنةً بالبيولوجيا ، فقد تابعت منصبًا في جامعة هارفارد للتوسع في معرفة علم الأحياء التي أمتلكها بالفعل بطريقة أكثر تقنية. لقد فتح هذا التدريب عيني. كنت أعمل طوال الصيف مع Sudhakaran Prabhakaran على دراسة الفسفرة متعددة المواقع لبروتين مسار EGF ERK (المعروف تقنيًا باسم MAPK). لقد كنت أدرس أشكال الفوسفو المتعددة من ERK وقياس نسب شكل الفوسفور استجابة لتحفيز EGF. لقد عملت مع العديد من التقنيات مثل زراعة الخلايا البكتيرية والثديية (هيلا) ، وتحويل البلازميد ، والترسيب المناعي ، وتنقية البروتين ، وتشغيل المواد الهلامية ، وقياس الطيف الكتلي ، وأكثر من ذلك بكثير. آمل ألا آخذ المعرفة التي اكتسبتها من هذه الوظيفة وتطبيقها في كل مكان أذهب إليه من هنا فصاعدًا في مسيرتي المهنية فحسب ، بل آمل أيضًا أن أعود إلى هنا وأواصل العمل في نفس المشروع.

ماكسيميليان نجوين

انطلاقاً من روح مقاربة شرودنجر للمسألة القديمة المتمثلة في "ما هي الحياة؟" ، فإنني مهتم بالكشف عن المبادئ الفيزيائية التي يمكننا من خلالها استخلاص التعقيد في النظم البيولوجية. تقع بعض مجالات علم الأحياء الحديث عند مفترق طرق حيث قد تكون أخيرًا عرضة للعلاج النظري. متحمسًا لإمكانية مثل هذه الاكتشافات ، جئت إلى مجموعة Gunawardena لبدء غزوتي في علم الأحياء الكمي.

تتمثل المشكلة المفتوحة في معالجة المعلومات الخلوية في الفهم النظري للفيزياء التي يمكن من خلالها لعوامل النسخ والآليات التنظيمية الأخرى التحكم في التعبير الجيني. جنبا إلى جنب مع جيريمي وجون بيدل ، قمنا بالتحقيق في الديناميكا الحرارية لربط عامل النسخ المقترن (PMID 30762521). من خلال القيام بذلك ، اكتشفنا مفهوم المعاملة بالمثل ، الذي يلمح إلى إمكانية اكتشاف كميات وظيفية أخرى لأنظمة عدم التوازن.

حصلت على شهادتي البكالوريوس والماجستير في الهندسة الكيميائية من جامعة جورجيا للتكنولوجيا وجامعة كورنيل ، على التوالي ، وأنا الآن أسعى للحصول على درجة الدكتوراه في الفيزياء الحيوية في جامعة برينستون.

آخر تحديث في 22 أبريل 2019

جيريمي أوين

كنت في مجموعة Gunawardena بصفتي Systems Biology USRI في صيف عام 2012 ، وعملت على توسيع بعض النتائج الرياضية ، التي تم إنشاؤها مسبقًا لحالة خاصة من حلقة Goldbeter-Koshland (تم الوصول إليها باستخدام إطار العمل الخطي) ، إلى العامة الحالة ، حيث يمكن عكس الإنزيمات المتضمنة في الحلقة ، انظر ملصقي على هذا. أنا مؤلف مشارك لورقة بحثية حول هذا الموضوع ، نطبق فيها النظرية لتحليل كفاءة التبديل للإنزيم ثنائي الوظيفة 6-phosphofructo-2-kinase / fructose-2،6-bisphosphatase ، الذي ينظم استقلاب الجلوكوز. عدت في صيف 2013 للعمل على بعض القضايا الرياضية الأخرى المتعلقة بالإطار الخطي و ndashexploring ، على سبيل المثال ، ما هي الشروط التي قد تضمن الاستقرار الأحادي في أنظمة التعديل العامة بعد الترجمة.

أنا طالب جامعي أدرس الرياضيات في King's College ، كامبريدج. أنا متحمس للرياضيات من حيث جمالها الجوهري ولتطبيقها لوصف الظواهر الطبيعية ، وخاصة في علم الأحياء.

آخر تحديث في 11 أغسطس 2013

صموئيل بادولا

طالب بحث UG
بادولاسف فيالبريد الإلكتروني

أنا طالب جامعي صاعد في كلية ووفورد حيث أدرس الرياضيات. أنا أعمل مع كريس نام على حساب حاجز هوبفيلد لخصوصية وكفاءة CRISPR-Cas9 ، انظر ملصقي على هذا.

آخر تحديث في 9 سبتمبر 2019

فيشال باتيل

طالب بحث UG
write2vishal في gmail.com

أنا طالبة في السنة الرابعة من جامعة آنا في تشيناي بالهند أقوم بإعداد أطروحة التخرج في الهندسة الحيوية. بالتبديل بين أساسيات الرياضيات والكيمياء الحيوية وأجهزة الكمبيوتر ، أقوم بدراسة الدرجة التي يمكن أن يتنبأ بها تحليل توازن التدفق بشكل صحيح بالتدفقات الداخلية في الخميرة. أيضًا ، أحاول تنفيذ معادلات الكتلة الحيوية المختلفة وقيود إضافية لتحسين الموثوقية والقدرة على التنبؤ للشبكات الحالية المتاحة في الأدبيات. سأتابع دراساتي العليا في جامعة كاليفورنيا ، إيرفين. موقع الويب الخاص بي هنا

آخر تحديث في 4 مايو 2009

دبداس بول

حاليًا ، أنا طالب دكتوراه في السنة الثالثة (دكتور-إنغ) في معهد نظرية النظم والتحكم الآلي ، جامعة شتوتغارت ، ألمانيا ، أعمل مع الأستاذة نيكول رادي. أطروحتي هي تطوير إطار نظري لمقارنة مبدأ تصميم الطبيعة والهياكل التقنية الحاملة من حيث المتانة والأمثل والوظائف المتعددة.

في السابق ، أكملت درجتي البكالوريوس والماجستير في علوم الكمبيوتر والهندسة من جامعة غرب البنغال للتكنولوجيا ومن جامعة جادافبور بالهند على التوالي. بصفتي مهندسًا في علوم الكمبيوتر ، فقد عملت على المعلوماتية الحيوية القائمة على البيانات وتطبيق نظرية الرسم البياني الطيفي في الشبكات واسعة النطاق.

لاحقًا ، تابعت أيضًا درجة الماجستير المزدوجة في بيولوجيا الأنظمة الحسابية من المعهد الملكي للتكنولوجيا (KTH) ، السويد وجامعة آلتو ، فنلندا حيث عملت على علم الأحياء الحسابي القائم على التعلم الآلي (تحديدًا على طرق النواة للتنبؤ بالبروتين- تفاعلات البروتين) وكذلك على تقنيات تقدير المعلمات للحركية الكيميائية العشوائية على أساس المعادلة الكيميائية الرئيسية.

في مختبر جيريمي كطالب دراسات عليا زائر ، أقوم بتطوير نموذج لديناميكيات البلمرة الثانية (التوظيف ، والإيقاف المؤقت ، والاستطالة ، والإنهاء) من أجل إحضار التعبير الجيني والتنظيم ضمن إطار عمل خطي موحد مشترك.

آخر تحديث في 6 سبتمبر 2017

دانييلا بيري

طالب بحث UG
danielaperry2015 في gmail.com

آخر تحديث في 15 أغسطس 2016

جريجوري بيترز

أنا حاليًا متدرب جامعي من جامعة باسيفيك اللوثرية في تاكوما ، واشنطن حيث أعمل للحصول على درجات علمية في الكيمياء الحيوية وعلوم الكمبيوتر. تدور اهتماماتي حول ديناميكيات البروتين واكتشاف العقاقير الحسابية.

Allostery هي التفاعلات غير المباشرة بين مواقع الربط المتميزة ، والتي تسمح بتنظيم النشاط. توجد البروتينات في مجموعة من التوافقات ، وتتحول باستمرار بين التطابقات المختلفة مع طاقات مختلفة. يمكن رؤية توزيع المجموعة المطابقة من خلال مشهد الطاقة الحرة للبروتين. يمكن النظر إلى Allostery على أنه إعادة توزيع ، أو "تحول سكاني" ، يحدث بسبب الاستقرار النسبي للتغيير المطابق. يتضمن عملي في مختبر Gunawardena ، المدعوم من NSF 1462629 ، دراسة المجموعات التوافقية والمناظر الطبيعية للطاقة الحرة للبروتينات كوسيلة لفهم التباين من أجل تطبيق الإطار الخطي لوصف تنظيم التباين والتباين ، انظر الملصق الخاص بي.

آخر تحديث في 3 سبتمبر 2017

سودهاكاران براباكاران

زميل ما بعد الدكتوراه
(617) 432 4842
sp339 في cam.ac.uk

أنا أحد علماء الأحياء ذوي التفكير النظري للانضمام إلى برنامج الخلية الافتراضية. عملت على مشكلة طي البروتين في أطروحة الماجستير من جامعة جواهر لال نهرو (نيودلهي ، الهند). بعد ذلك أصبحت مهتمًا بعلم الأعصاب والفصام وانضممت إلى مجموعة الدكتورة سابين بان للحصول على درجة الدكتوراه في جامعة كامبريدج. تطور مشروع الدكتوراه الخاص بي إلى نهج وظيفي قائم على الأنظمة لفهم مرض انفصام الشخصية باستخدام منصات "ذرية" متعددة (Prabakaran et al ، 2004 ، Swatton et al 2004). خلال رسالتي للدكتوراه ، أدركت أن التحقيق في اللقطات "الذرية" لتغيرات الجينات والبروتين والدهون والتغيرات الأخرى في التعبير عن المكونات الخلوية ليست كافية لفهم مثل هذه الظواهر البيولوجية المعقدة. أعتقد أنه يتعين على المرء أن يبحث في ديناميكيات تفاعلات هذه المكونات للوصول إلى فرضية ، يحتاج المرء من أجلها إلى نمذجة رياضية وحسابية أيضًا. وهكذا تحول اهتمامي إلى ديناميكيات وآليات التفاعلات والتنظيم الذاتي في الأنظمة البيولوجية المعقدة.

انضممت إلى مختبر د. Gunawardena في عام 2006 لتطوير طرق لتحديد أنماط الفسفرة في الفسفرة متعددة المواقع وفهم دورها في نقل الإشارات ومعالجة المعلومات في خلايا الثدييات. أنا حاليًا قائد مجموعة في قسم علم الوراثة في كامبريدج.

آخر تحديث في 13 تشرين الثاني (نوفمبر) 2016

كولجا شلايش

درست التكنولوجيا الحيوية الجزيئية (بكالوريوس ، ماجستير) في هايدلبرغ ، ألمانيا. أنا حاليًا طالبة دكتوراه في قسم علم الوراثة المناعية (الأستاذ الدكتور بيتر كرامر) ، في مجموعة الأستاذة الدكتورة إينا لافريك ، في المركز الألماني لأبحاث السرطان في هايدلبرغ. عملت في مختبر جيريمي كمتدرب صيفي في عام 2009 حول قدرات التحويل لأنظمة الفسفرة متعددة المواقع. تُظهر هذه الأنظمة قابلية تعدد غير محدودة وبالتالي يمكن استخدامها كوحدات تخزين ذاكرة قادرة على تخزين بتات متعددة من المعلومات. لقد قمت بتحليل إمكانية التبديل بين أي حالة مستقرة ، والتي ستكون ذات أهمية لعلماء الأحياء التركيبية على وجه الخصوص. في مشروع الدكتوراه الخاص بي أعمل على مسار إشارات CD95. ينتمي CD95 (المعروف أيضًا باسم Fas / APO-1) إلى عائلة نخر الورم لمستقبلات الموت. إلى جانب وظائفه المعروفة في تحفيز موت الخلايا ، يمكن أن يؤدي أيضًا إلى تنشيط المسارات غير المبرمجة مما يؤدي إلى تكاثر الخلايا. ومع ذلك ، لا يزال من غير المعروف كيف يتم اتخاذ القرار بين هاتين النتيجتين. عند تحفيز CD95 ، يتم تشكيل مجمع إشارات متعدد المكونات يحفز الموت (DISC). من أجل الحصول على مزيد من التبصر في عملية اتخاذ القرار هذه ، قمت بدراسة القياس المتكافئ لـ DISC باستخدام لطخة غربية كمية ، وقياس الطيف الكتلي ، والفحص المجهري أحادي الخلية ، والنمذجة الرياضية. يعجبني بشكل خاص في بوسطن لأن هندستها المعمارية تشبه إلى حد بعيد المدن الأوروبية. أنا أحب المنطقة المحيطة ببوسطن كومون وبيكون هيل وسوق كوينسي.

آخر تحديث في 19 أغسطس 2012

أجيت شارما

أنا زميل أبحاث ما بعد الدكتوراه في مختبر Gunawardena. أكملت رسالة الدكتوراه. في عام 2014 من قسم الفيزياء في IIT Kanpur. خلال رسالتي لنيل درجة الدكتوراه. وأعمال بحثية لاحقة بعد الدكتوراه في ولاية بنسلفانيا ، لقد طورت وطبقت نظريات لفهم مختلف ميزات عدم التوازن لعملية تخليق البروتين وطي البروتين المشترك. في تلك المشاريع ، قمت أيضًا بتحليل بيانات التسلسل عالية الإنتاجية باستخدام أدوات الميكانيكا الإحصائية غير المتوازنة.

في مختبر Gunawardena ، يهدف بحثي إلى فهم دور حركيات عدم التوازن في معالجة الإشارات الخلوية ، وتحديداً في سياق تنظيم الجينات.

آخر تحديث في 20 سبتمبر 2018

جوليان ستانلي

أنا طالب جامعي في جامعة نورث إيسترن أدرس علوم الكمبيوتر وعلم الأحياء وأعمل كمتدرب صيف 2018 مع Shreepriya Das. أنا مهتم عمومًا بعلم الوراثة والجينوميات بجميع مظاهرها ، ولكن بشكل خاص عندما تكون رؤاهم ذات صلة بالطب السريري. خلال صيف 2018 ، أعمل على تحديد المحددات الجينية لسرطان بطانة الرحم من النوع 1 والنوع 2 من بيانات الجينوم الكامل ، انظر ملصقي على هذا.

آخر تحديث في 16 سبتمبر 2018

مونيكا سوليفان

انضمت مونيكا إلى المختبر في عام 2010 باعتبارها Systems Biology USRI ، بدعم من NSF 0856285. كانت تتخصص في الرياضيات في جامعة ولاية فورت فالي في جورجيا. عملت مع Bobby Karp لتطوير نموذج رياضي لمسار Wnt ، شاهد ملصقها على هذا.

آخر تحديث في 10 سبتمبر 2012

براني تالا

أنا طالبة صاعدة في مدرسة هوراس غريلي الثانوية في نيويورك. هذا الصيف ، أتدرب في مختبر Gunawardena للعمل على مشاكل بحثية مثيرة في تقاطع الرياضيات والبيولوجيا والفيزياء.

يتضمن استقصائي خصائص الحالة المستقرة لدورات التعديل التساهمي العامة ووظيفتها كمفاتيح بيولوجية. أعمل تحت إشراف جون بيدل للتوسع في النتائج الرياضية السابقة من خلال تحديد مدى تأثير الكميات الفيزيائية مثل القوة الديناميكية الحرارية على الحساسية والنطاق الديناميكي لمثل هذه الأنظمة لرؤية ملصقي على هذا.

آخر تحديث في 9 سبتمبر 2019

إزجي تيماموغولاري

كنت متدربًا صيفيًا في عام 2010 في مختبر جيريمي ، حيث عملت مع جيريمي وتاثاجاتا وديفيد. كان لدينا السؤال التالي كنقطة انطلاق: لماذا تستخدم الخلايا في بعض العمليات إنزيمات ثنائية الوظيفة لتفاعلين مختلفين ، بدلاً من استخدام إنزيمين مختلفين؟ درسنا العديد من المسارات التي تحتوي على إنزيمات ثنائية الوظيفة ثم توصلنا إلى نموذج رياضي لمسار إشارات EnvZ / OmpR الذي يأخذ في الاعتبار تباين EnvZ بالإضافة إلى وظيفته الثنائية. قد يشير هذا النموذج إلى أن التباين والوظيفة الثنائية معًا يزيدان من قوة النظام للاضطرابات الداخلية ، مثل التقلبات في تركيز EnvZ.

تخرجت من برنامج التخصص المزدوج في البيولوجيا الجزيئية وعلم الوراثة والرياضيات في جامعة بوغازيتشي ، وأنا الآن مرشح لدرجة الدكتوراه في قسم الرياضيات في جامعة ديوك ، حيث أعمل مع مايك ريد. أنا مهتم بشكل خاص بكيفية حصول الخلايا على معلومات حول بيئتها على الرغم من كونها "محصورة" بأغشيتها وكيفية معالجتها لهذه المعلومات.

آخر تحديث في 20 نوفمبر 2012

مات طومسون

مات حاليًا زميل في بيولوجيا الأنظمة في مركز UCSF للأنظمة والبيولوجيا التركيبية. جاء إلى المختبر أولاً كمساعد باحث ثم أصبح طالب دراسات عليا في برنامج هارفارد للفيزياء الحيوية. عمل في العديد من المشاريع التجريبية والحسابية والنظرية ، وشارك في تأليف ورقة بحثية واحدة عن "ب الصغير" ومؤلف أول في اثنين آخرين عن الفسفرة متعددة المواقع.

آخر تحديث في 28 يونيو 2013

فيد توبكار

طالب بحث UG
فيدوبكار في college.harvard.edu

أنا طالب جامعي في كلية هارفارد أركز في البيولوجيا الكيميائية والفيزيائية مع ثانوية في علوم الكمبيوتر. وبدعم من PRIZE خلال صيف 2013 ، بدأت في التحليل الحسابي لمجموعات بيانات ENCODE الضخمة في مناطق المروجين ، مع تكريس معظم انتباهي لتحليل ربط عامل النسخ. أتناول موضوع البيانات الضخمة هذا مع وضع السؤال التالي في الاعتبار: كيف يمكننا تقليل هذا التعقيد البيولوجي المتنوع إلى شيء يسهل فهمه؟ يمكنك مشاهدة عرض الجائزة الخاص بي هنا. آمل أن أستمر في متابعة هذا العمل في الخريف وأربطه في النهاية مرة أخرى بتطبيق مقياس الجينوم للإطار الخطي لمختبرنا.

يمكنك عرض موقع الويب الخاص بي على vedtopkar.com.

آخر تحديث في 11 أغسطس 2013

سيو تران

طالب بحث UG
tsieu95 في vt.edu

كنت متدربًا صيفيًا في Systems Biology USRI في عام 2016 ، بدعم من NSF 1462629. عملت مع Javier Estrada وآخرين لفهم مدى تعقيد نمط التنشيط والقمع لجين ينظمه عامل نسخ واحد ، انظر ملصقي الذي يصف هذا العمل . عندما لا أعمل في جامعة هارفارد ، أدرس الرياضيات وعلم الأحياء الدقيقة والعلوم البيولوجية في جامعة فرجينيا للتكنولوجيا. كان الصيف في مختبر Gunawardena فرصة رائعة بالنسبة لي لأنني لم أكن على دراية بمجموعة متنوعة من أبحاث بيولوجيا الأنظمة الموجودة هناك. آمل أن أستمر في التوسع في عملي وتطوير نموذجي الخاص في المستقبل.

آخر تحديث في 1 سبتمبر 2016

غاري تايري

أنا متدرب جامعي من جامعة أريزونا. لقد كنت أدرس الهندسة الطبية الحيوية ، والبيولوجيا الجزيئية والخلوية ، والكيمياء الحيوية على أمل متابعة البحث في الهندسة الوراثية والبيولوجيا التركيبية بعد التخرج.

يركز بحثي في ​​مختبر Gunawardena على تطوير نموذج قادر على تمثيل الطبيعة التوليفية والمعتمدة على السياق بدقة التي تحدثها التعديلات اللاجينية على تنظيم الجينات ، انظر إلى الملصق الخاص بي. لا يُفهم حاليًا ما إذا كانت التأثيرات التنظيمية المعقدة التي تم تسجيلها في الأدبيات لها تأثير كبير على تنظيم الجينات أو لها تأثير ضئيل على التنظيم ككل أم لا. ولكن نظرًا لأن دوائر الجينات الاصطناعية المستخدمة في الكائنات حقيقية النواة تصبح أكثر تعقيدًا ، فإن آليات تنظيم الوراثة اللاجينية هذه سوف تحتاج إلى وصف لضمان هندسة الجينوم المناسبة. وبالتالي ، آمل أن يكون عملي قادرًا على المساعدة في فهم تنظيم الوراثة اللاجينية بشكل أفضل بالإضافة إلى توفير أداة جديدة لعلماء الأحياء الاصطناعية في المستقبل.

آخر تحديث في 3 سبتمبر 2017

بن أوليان

طالب بحث UG
bnu2101 في كولومبيا

عمل بن على جوانب مختلفة من نظام ب الصغير. يدرس علوم الكمبيوتر في جامعة كولومبيا.

آخر تحديث في 24 فبراير 2006

ايشواريا فينكاتراماني

أنا طالب جامعي في جامعة كاليفورنيا في سان دييغو متخصصًا في الفيزياء والكيمياء الحيوية. حاليًا ، بصفتي متدربًا صيفيًا في مجموعة Gunawardena ، أحاول العثور على أنظمة بيولوجية تظهر ترتيبًا أعلى بشكل تعاوني وتستخدم الديناميكيات الجزيئية لتحديد كمية النحاس. في الماضي ، أجريت بحثًا في علم الأحياء الحسابي لتحديد الأدوية المحتملة ضد طفيلي الملاريا Plasmodium falciparum في مجموعة Andy McCammon في جامعة كاليفورنيا. لقد عملت أيضًا مع مجموعات بحثية تجريبية لتطوير برنامج لتحديد كمية الحمض النووي الريبي في تجارب FISH ورمزًا لمحاكاة موجات Cdk1 أثناء مزامنة المرحلة S في أجنة ذبابة الفاكهة. خارج البحث ، أستمتع بالسفر والمشي لمسافات طويلة واستكشاف أماكن جديدة والتعرف على ثقافات مختلفة.

آخر تحديث في 12 يوليو 2017

نينغ وانغ

أنا طالب جامعي في السنة الثالثة في جامعة العلوم والتكنولوجيا في الصين (USTC) ، في قسم الهندسة الكهربائية. في مجموعة Gunawardena ، أعمل مع Tathagata Dasgupta و David Croll لمقارنة نماذج من مادة thymidylate synthase / tetrahydrofolate reductase في الحالات ثنائية الوظيفة وأحادية الوظيفة. بصفتي عضوًا سابقًا في فريق USTC iGEM ، فأنا مهتم بالبيولوجيا التركيبية وبيولوجيا الأنظمة. أحب البحث في بنية كل من شبكات تنظيم الإنزيمات والجينات.

آخر تحديث في 13 أغسطس 2012

داني ويلز

قضيت صيف عام 2009 في مختبر Gunawardena كجزء من برنامج USRI لتحديد ثوابت سلسلة الفسفرة الجديدة. بالتوسع في العمل السابق ، استخدمت تقنيات من الجبر التبادلي والهندسة الجبرية لتحديد ثلاثة متغيرات جديدة مستقلة عن المعلمات والتي يمكن استخدامها للتمييز بين طوبولوجيا التسلسل المختلفة تجريبيًا. بعد التخرج من كلية كارلتون وحصلت على درجة البكالوريوس في الرياضيات في عام 2010 ، أصبحت الآن طالب دراسات عليا في السنة الثالثة في قسم العلوم الهندسية والرياضيات التطبيقية في جامعة نورث وسترن ، حيث أحمل زمالة أبحاث الخريجين من NSF. عملي الحالي في بيولوجيا الأنظمة الحسابية ، وتحديداً في تطوير الأساليب النظرية لتعديل الاستجابة للضوضاء في الشبكات التنظيمية الوراثية. أنا مهتم على نطاق واسع بالطرق الحسابية للتصميم البيولوجي وفي دمج الأساليب الرياضية التطبيقية بشكل أعمق في علم الأحياء الحديث.

آخر تحديث في 20 نوفمبر 2012

دارنيل (أدريان) ويليامز

اسمي دارنيل كيث أدريان ويليامز وأنا متحمس للأبحاث التي لها تأثير مباشر على صحة الناس ورفاههم. أشارك حاليًا في أبحاث ALS للكيمياء المناعية التي تتضمن تلطيخ العصب الحركي للفئران للمساعدة في فحص التعبير عن القنوات الأيونية على غشاء الخلية للعصبونات الحركية. في مختبر Gunawardena ، أعمل حاليًا على تحديد الاختلافات التنظيمية في تحديد نوع الخلايا العصبية عبر سلالة الحيوان (خاصة دودة C. elegans.) الملصق الذي يصف عملي هنا. تم انتخابي نائبًا لرئيس الهيئة الطلابية وسأخدم في العام الدراسي القادم ، إلى جانب اختياري لتمثيل أمريكا الشمالية في الاجتماع السنوي لمنظمة الصحة العالمية في سويسرا في مبنى الأمم المتحدة لمدة أسبوع للضغط من أجل خفض أسعار الأدوية في المركز الثالث دول العالم. أنا لاعب غولف متعطش وأحب القيادة ، أتسكع مع أصدقائي ، وأستمع إلى الموسيقى.

آخر تحديث في 16 سبتمبر 2018

صوفي وودوارد

باحث UG
سوودوارد في college.harvard.edu

أنا طالبة جامعية في كلية هارفارد أدرس الرياضيات والإحصاء ، ومتحمسة بشكل خاص لعلم الأحياء. لقد أنهيت سنتي الثالثة وآمل أن أتقدم بطلب للحصول على برامج الدراسات العليا في الإحصاء الحيوي في الخريف. من خريف 2019 إلى 2020 ، عملت مع مختبر Gunawardena تحت إشراف زميلة أبحاث ما بعد الدكتوراه روزا مارتينيز كورال ، لدراسة إنفاق الطاقة أثناء ربط عامل النسخ. على وجه التحديد ، نظرت إلى عدم رتابة وظائف تنظيم الجينات انظر هذا الملصق في عملي. أقوم هذا الصيف بالبحث مع مختبر Dominici في مدرسة Chan ، وأدرس طرقًا لتصحيح التحيز البيئي في تحليل إحصائي حول COVID-19 وتلوث الهواء.

آخر تحديث في 4 مايو 2021

مارك شيانغ

أنا طالب جامعي في UMass Amherst وتخصص مزدوج في علم الأحياء والرياضيات. حاليًا ، بصفتي متدربًا صيفيًا في مختبر Gunawardena ، أقوم بتطوير نماذج رياضية للتعاون الحركي في المستقبلات الأحادية ، انظر ملصقي على هذا العمل. خارج البحث ، أحب الاستماع إلى الموسيقى والتخييم وأريد تعلم التزلج أيضًا.

آخر تحديث في 16 سبتمبر 2018

يانجكينج شو

زميل ما بعد الدكتوراه
yangqing_xu في hms.harvard.edu

لدي خلفيات متعددة التخصصات في كل من العلوم البيولوجية والهندسة. مع درجة البكالوريوس في الهندسة الهيدروليكية ، بنى بعض زملائي السابقين سد الخوانق الثلاثة على نهر اليانغتسي ، أحد أكبر الإنشاءات الهيدروليكية في العالم. بصفتي الشخص الغريب بين زملائي في الفصل ، فقد طورت اهتماماتي في التدفق داخل القلب ، بدلاً من ذلك داخل التوربينات. لذلك حصلت أولاً على درجة الماجستير في ميكانيكا السوائل الحيوية. بعد التركيز على تطوير التكنولوجيا الحيوية خلال فترة الدكتوراه (في الهندسة الطبية الحيوية) ، انضممت إلى المختبر الحالي وبدأت حياتي المهنية في بيولوجيا الأنظمة. يركز بحثي الحالي على دراسة الديناميكيات المعقدة للشبكات البيولوجية باستخدام مزيج من التصوير الكمي وبيولوجيا الخلية والنمذجة الرياضية. تؤدي الديناميكيات المقاسة إلى نماذج رياضية لهيكل الشبكة وتنظيمها ، والتي يمكن اختبارها بشكل تكراري بالتجارب. أقوم بتطبيق نهج بيولوجيا الأنظمة متعدد التخصصات للتحقيق في معالجة المعلومات واتخاذ القرار في إشارات عامل النمو وموت خلايا الالتهام الذاتي في خلايا الثدييات.

دائمًا ما أتخيل خلية كبلد به العديد من المصانع وحركة المرور الكثيفة على الطرق المتصلة ، وكانت رحلة ممتعة في مثل هذا العالم المفعم بالحيوية لمشاهدة الإنشاءات والمواصلات والمعارك فيه. بصفتي عالم أحياء أنظمة ، أدهشني مرارًا وتكرارًا كيف تنسق الخلية العديد من الأنشطة والوظائف كمملكة متكاملة ومنظمة ذاتيًا ، ولكن بدون ملك. بالنظر إلى الوراء على مدى العقد الماضي ، تقلص حجم بحثي من كيلومترات إلى نانومتر ، ولكن مع زيادة كبيرة في التعقيد في النظام. أجدها رائعة حقًا.

آخر تحديث في 21 ديسمبر 2008

كاثرين شيويه

أثناء وجودها في مختبر Gunawardena في 2010-2011 ، عملت كاثرين مع Tathagata Dasgupta على نمذجة إنزيم ثنائي الوظيفة ثيميديلات سينثيز ثنائي هيدرو فولات اختزال (TS-DHFR). تخرجت من جامعة هارفارد بدرجة علمية في البيولوجيا الكيميائية والفيزيائية في مايو 2013 وتخطط للالتحاق ببرنامج الدكتوراه في علوم الجينوم بجامعة واشنطن.

آخر تحديث في 28 يونيو 2013

بينشو يوردانوف

زميل ما بعد الدكتوراه
بنشو يوردانوف في hms.harvard.edu

تكمن اهتماماتي البحثية في مجال بيولوجيا الأنظمة ، ولا سيما التركيز على تطوير المناهج الحسابية والرياضية للكشف عن الآليات الكيميائية الحيوية لمعالجة المعلومات الخلوية. لقد درست المعلوماتية الحيوية والبيولوجيا الحاسوبية في جامعة جاكوبس بريمن. أكملت الدكتوراه في ETH Zurich ، حيث عملت في مجموعة البروفيسور يورغ ستيلينج وبحثت في إشارات الخلايا التفاضلية من خلال عدسة نظرية الرسم البياني الجبري.

يهدف بحثي لما بعد الدكتوراه في مجموعة Gunawardena إلى توسيع نطاق "الإطار الخطي" من خلال تخفيف افتراض الفصل على النطاق الزمني. من خلال النظرية المطورة ، أخطط لدراسة العمليات المتزامنة التي تعمل على عوامل النسخ مثل التعديلات الملزمة غير المحددة وما بعد الترجمة بعيدًا عن الحمض النووي. يتم دعم عملي من قبل مؤسسة العلوم الوطنية السويسرية.

آخر تحديث في 29 نوفمبر 2018

زيوان تشاو

باحث UG
ziyuanzhao في college.harvard.edu

أنا حاليًا طالبة في السنة الثانية في كلية هارفارد وأعتزم دراسة البيولوجيا الكيميائية والفيزيائية. انضممت إلى المختبر في ربيع 2020 وسأعمل مع Rosa Martinez-Corral خلال الصيف بدعم من برنامج Harvard's Research in Science and Engineering (PRIZE). سيركز مشروعي على الجوانب النظرية للتعلم أحادي الخلية. هدفي الأكاديمي طويل المدى هو أن أكون قادرًا على فهم الأنظمة البيولوجية من الناحية الكمية باستخدام النماذج والتجارب ، وآمل أن تبدأ الرحلة بجدية هذا الصيف.


الكيمياء الحيوية والطب الحيوي والمستحضرات الصيدلانية

1) تحديد العبارة الصحيحة فيما يتعلق بوظيفة الحمض النووي الريبي (RNA)
أ) يعمل الرنا المرسال كقالب لتخليق البروتينات
ب) يعمل الحمض الريبي النووي النقال كجزيء محول لإضافة الأحماض الأمينية واستطالة سلسلة الببتيد
ج) يعمل RNA الريبوسوم كآلات لتخليق البروتين
د. كل ما ورداعلاه

2) أي من الحمض النووي الريبي التالي يخدم الوظائف التنظيمية بما في ذلك التضفير وإسكات الجينات؟
أ) مرنا
ب) الحمض الريبي النووي النقال
ج) الرنا الريباسي
د) الحمض النووي الريبي الصغير

3) أي من العبارات التالية غير صحيح فيما يتعلق بالنسخ / تخليق الحمض النووي الريبي؟
أ) يحدث تخليق الحمض النووي الريبي في النواة
ب) على عكس توليف الحمض النووي ، يتم نسخ التسلسل الانتقائي الوحيد للحمض النووي إلى الحمض النووي الريبي
ج) يتطلب تخليق الحمض النووي الريبي (RNA) امتدادًا قصيرًا من بادئات RNA
د) تسلسل الحمض النووي ، والبروتينات المحددة ، والحمض النووي الريبي الصغير تنظم تخليق الحمض النووي الريبي.

4) شقوق السكر البنتوز هي الفرق الهيكلي الأساسي بين DNA و RNA. بالإضافة إلى أي مما يلي يرتبط بشكل أساسي بجزيء الحمض النووي الريبي؟
أ) يتكون الحمض النووي الريبي من الثايمين بدلاً من اليوراسيل
ب) جزيئات الحمض النووي الريبي هي بنية متفرعة للغاية
ج) جزيئات الحمض النووي الريبي لديها تعقيدات هيكلية أعلى
د) جزيئات الحمض النووي الريبي مضادة للتوازي ومزدوجة تقطعت بهم السبل

5) في بدائيات النوى ، يحفز بوليميراز الحمض النووي الريبي تخليق:
أ) مرنا
ب) الرنا الريباسي
ج) الحمض الريبي النووي النقال
د. كل ما ورداعلاه

6) إن إنزيم RNA polymerase هو إنزيم متعدد الوحدات الفرعية يتعرف على تسلسل النوكليوتيدات المتوافق (منطقة المروج) في بداية موقع بدء النسخ. في بدائيات النوى ، يتكون تسلسل المروج الإجماعي من 5-TATAAT-3 'المعروف أيضًا باسم
أ) صندوق محسن
ب) صندوق Pribnow
ج) وحدة النسخ
د) لا شيء مما سبق

7) بوليميراز الحمض النووي الريبي يحفز تخليق الحمض النووي الريبي عن طريق إضافة أحادي الفوسفات النيوكليوتيد وإطلاق بيروفوسفات للنيوكليوتيد ثلاثي الفوسفات. بوليميراز الحمض النووي الريبي
أ) يتكون من نشاط نوكلياز خارجي 5'-3 '
ب) يفتقر إلى نشاط نوكلياز داخلي 3'-5 '
ج) هو إنزيم عالي الدقة
د. كل ما ورداعلاه

8) في بدائيات النوى ، يتكون بوليميريز الحمض النووي الريبي الإنزيمي من أربع وحدات فرعية أساسية هي 2α ، 1β ، 1β 'ومحفز يتعرف على الوحدة الفرعية σ. قد يتطلب أيضًا عامل إنهاء لإنهاء عامل النسخ. أي مما يلي يعتبر عامل نسخ؟
أ) عامل جاما
ب) عامل دلتا
ج) عامل إبسيلون
د) عامل rho

9) في بدائيات النوى ، TTGACA عبارة عن تسلسل نوكليوتيد إجماعي في المنبع مطلوب للنسخ. خطوة
أ) البدء
ب) استطالة
ج) الإنهاء
د) السد

10) يحدث إنهاء النسخ بطريقة تعتمد على rho وبطريقة مستقلة عن rho. أي مما يلي غير صحيح فيما يتعلق بإنهاء النسخ
أ) تتعرف بروتينات rho على المنطقة الغنية بـ C بالقرب من 3'end من الحمض النووي الريبي المركب حديثًا
ب) يحدث الإنهاء المستقل عن rho عندما يصل النسخ إلى البنية المتناوبة مما يؤدي إلى تكوين دبابيس الشعر
ج) يتنافس بروتين rho مع RNA polymerase للارتباط بالنيوكليوتيدات
د) لا شيء مما سبق

11) ريفاميسين مضاد حيوي يستخدم في علاج مرض السل. إنه ملزم بـ. الوحدة الفرعية لبوليميراز الحمض النووي الريبي وتمنع بدء النسخ.
أ) α ،
ب) β
ج) σ
د) ζ

12) في حقيقيات النوى ، تكون عملية تخليق الحمض النووي الريبي أكثر تعقيدًا من بدائيات النوى. يتم تنظيم عملية تخليق الحمض النووي الريبي (RNA) من خلال بنية الكروماتين ، وتسلسلات المنبع والمصب ، وشركاء الربط ، وما إلى ذلك. أي مما يلي صحيح فيما يتعلق بعملية النسخ في حقيقيات النوى:
أ) تم العثور على الجينات الأكثر نسخًا بنشاط في شكل غير محكم من الكروماتين يسمى euchromatin
ب) تم العثور على الجزء الأكثر نشاطًا من الحمض النووي في بنية كروماتين مضغوطة تسمى heterochromatin
ج) تعديل هيستون مثل مثيلة ، أسيتيل ينظم نسخ الحمض النووي الريبي عن طريق تعديل بنية الكروماتين
د. كل ما ورداعلاه

13) في حقيقيات النوى ، تشارك ثلاثة أنواع مختلفة من بوليميرات RNA في تخليق فئة مختلفة من RNAs وهي: rRNA و tRNA و mRNA. إن بوليميراز الحمض النووي الريبي المطلوب لتخليق الرنا المرسال هو
أ) بوليميراز الحمض النووي الريبي أنا
ب) بوليميراز الحمض النووي الريبي II
ج) بوليميراز الحمض النووي الريبي الثالث
د) لا شيء مما سبق

14) في حقيقيات النوى ، تكون متواليات المروج الإجماع (صندوق TATA) المطلوبة لبدء النسخ موجودة بشكل عام
أ) 10 نيوكليوتيدات منبع من موقع بدء النسخ (TSS)
ب) 25 نيوكليوتيد المنبع من المواد الصلبة الذائبة
ج) 10 نيوكليوتيدات المصب من المواد الصلبة الذائبة
د) 25 نيوكليوتيد المصب من المواد الصلبة الذائبة

15) المعززات عبارة عن تسلسلات DNA خاصة تعمل بنظام رابطة الدول المستقلة تزيد من معدل النسخ بواسطة بوليميراز الحمض النووي الريبي. أي مما يلي ينطبق على المعززات؟
أ) 10 عناصر النوكليوتيدات المنبع
ب) 25 نيوكليوتيد عناصر المصب
ج) تقديم أقرب أو 1000 ثانية من النيوكليوتيدات المنبع أو المصب من المواد الصلبة الذائبة
د. كل ما ورداعلاه

16) تغطية النوكليوتيدات يمنع الانقسام السريع للـ mRNA ويتم تحفيزه بواسطة guanylyltransferase. تحديد غطاء النوكليوتيدات الذي تم إرفاقه في نهاية 5 من مرنا.
أ) 5-ميثيل جوانوزين
ب) 7- ميثيل جوانوزين
ج) 5- أسيتيل جوانوزين
د) 7- أسيتيل جوانوزين

17) تعدد الأدينيل هو تعديل ما بعد النسخ الذي يعمل على استقرار الرنا المرسال ويمنع الانقسام. إجماع تسلسل PolyA هو
أ) (AAGAAA) ن
ب) (AACAAA) ن
ج) (عاتا) ن
د) (AAUAAA) ن

18) في حقيقيات النوى ، تتم معالجة النصوص الأولية لإزالة التسلسل المتداخل الذي ينتج عنه mRNA وتُعرف العملية باسم الربط. يسمى مجمع RNA ، البروتينات النووية التي تنفذ عملية الربط:
أ) بريموسوم
ب) شوكة الربط
ج) لصق
د) لا شيء مما سبق

19) دور جزيئات البروتين النووي الصغيرة النووية (snRNPs) هو
أ) لربط المواقع intronic وشرائح exon
ب) تسهيل حلقات الإكسونين في المحاذاة الصحيحة للربط
ج) كل ما سبق
د) لا شيء مما سبق

20) توجد الأجسام المضادة الذاتية ضد البروتينات النووية الصغيرة في
أ) ثلاسيميا بيتا
ب) الذئبة الحمامية الجهازية
ج) بيلة فينيل كيتون
د) لا شيء مما سبق

21) تنوع ربط الجسم المضاد هو نتيجة لنوع التضفير الذي ينتج متغيرات mRNA ومتغيرات البروتين عن طريق معالجة جزء مختلف من exons. تُعرف العملية باسم
أ) التنوع الربط
ب) التضفير البديل
ج) الربط المحافظ
د) لا شيء مما سبق

22) صندوق CAAT موجود في كثير
أ) محفزات بدائية النواة المنبع من صندوق تاتا
ب) المحفزات بدائية النواة هي في اتجاه مجرى صندوق TATA
ج) محفزات حقيقيات النوى هي منبع صندوق تاتا
د) محفزات حقيقيات النوى هي في اتجاه مجرى صندوق TATA

إجابات متعددة الاختيارات
1- د) كل ما سبق
2-د) RNA صغير
3- ج) يتطلب تخليق الحمض النووي الريبي (RNA) امتدادًا قصيرًا من بادئات RNA
4- أ) يتكون الحمض النووي الريبي من الثايمين بدلاً من اليوراسيل
5- د) كل ما سبق
6-ب) مربع Pribnow
7-ب) يفتقر إلى نشاط نوكلياز داخلي 3'-5 '
8- د) عامل رو
9-أ) بدء
10) -c) يتنافس بروتين rho مع RNA polymerase للارتباط بالنيوكليوتيدات
11- ب) β
12- د) كل ما سبق
13-ب) بوليميراز الحمض النووي الريبي الثاني
14-ب) 25 نيوكليوتيد المنبع من المواد الصلبة الذائبة ،
15-ج) تظهر أقرب أو 1000 ثانية من النيوكليوتيدات في بداية أو أسفل مجرى TSS ،
16-ب) 7- ميثيل جوانوزين
17 د) (AAUAAA) ن
18 ج) سبليسيوسوم
19-ج) كل ما سبق
20-ب) الذئبة الحمامية الجهازية ، 21- ب) التضفير البديل
22-أ) محفزات بدائية النواة المنبع لصندوق تاتا


سيسيليا ليندغرين: السمنة وعلم الوراثة

تؤثر المتغيرات الجينية على السمنة على مستوى السكان. يعد توزيع الدهون محددًا إضافيًا للمخاطر الفردية: ترتبط نسبة الهدر / الورك بمرض السكري المرتبط بالعمر واضطرابات القلب والأوعية الدموية وبعض أنواع السرطان. قد يساعدنا فهم المسارات البيولوجية الأساسية في إنشاء علاجات أفضل وإجراءات وقائية أفضل.

س: ما مقدار السمنة التي يمكن أن نلومها على جيناتنا؟

CL: تُقاس السمنة عمومًا من خلال النظر إلى وزن جسم شخص ما من خلال الطول بالأمتار المربعة ، وهي مقياس للسمنة العامة. تحدث السمنة عندما يأكل الشخص كثيرًا ويمارس القليل جدًا من التمارين. هناك دراسات وبائية تشير إلى أن حوالي 70٪ من التباين في مؤشر كتلة الجسم يرجع إلى العوامل الوراثية. ومع ذلك ، مع الأبحاث الحديثة ، وجدنا حوالي 30 جينًا ومنطقة جينية مرتبطة بمؤشر كتلة الجسم ، لكن يمكننا فقط تفسير حوالي 10 ٪ من هذا التباين. إذا نظرت إلى الفرد ، الشخص الذي لديه جميع أليلات المخاطرة التي حددناها ، وقارنت ذلك الشخص بشخص آخر بنفس الطول وليس لديه أليلات مخاطرة ، فإن الشخص المصاب بأليلات الخطر سوف يزن ما بين 8-9 كيلوغرامات أكثر من الآخر. لا يزال تأثيرًا كبيرًا حتى لو ترجم إلى نسبة ضئيلة من التوريث.

س: هل هناك فرق بين الرجل والمرأة؟

CL: نعم ، النساء عمومًا أكثر بدانة قليلاً من الرجال ، لكن إذا نظرت إلى الرجال والنساء سترى أن أشكال أجسامنا ونمط دهون أجسامنا مختلفان تمامًا. إنه أمر مثير للاهتمام للغاية: إذا نظرت إلى النساء فإنهن يميلون إلى أن يكون لديهن شكل أجسام أكثر كمثرى حيث يتراكمون بشكل أكبر حول الأرداف والفخذين عادة ما يكونون على شكل تفاحة حيث يتجمعون أكثر في البطن وحولها. عادة ما نقيس توزيع الدهون بالنظر إلى محيط الخصر (يقاس بشريط بسيط) ومحيط الورك (يقاس بشريط بسيط آخر) وأخذ النسبة بين الاثنين. أظهرت الدراسات الوبائية أن حوالي نصف المتغيرات في نسبة الخصر إلى الورك يتم تحديدها وراثيًا وهناك مؤشرات على أن هذه النسبة أعلى مرة أخرى لدى النساء منها عند الرجال. لقد رأينا مؤخرًا في دراساتنا الجينية لنسبة الخصر إلى الورك حيث حددنا 14 منطقة جينية مرتبطة بنسبة الخصر / الورك ، أن نصف هذه المواقع لها تأثير أقوى بكثير على النساء من الرجال وهذا مثير للاهتمام حقًا. لا نعرف بالضبط السبب ، لكنه نوعًا ما يشير إلى بيولوجيا جديدة.

س: كيف يؤثر توزيع الدهون على التعرض لمرض السكري؟

CL: ترتبط نسبة الخصر / الورك أو توزيع الدهون على مستوى السكان بنتائج التمثيل الغذائي السلبية كما نسميها ، وأعني بذلك مرض السكري المرتبط بالعمر أو داء السكري من النوع 2 واضطرابات القلب والأوعية الدموية وحتى بعض أنواع السرطان. الآليات البيولوجية الأساسية لكيفية حدوث ذلك ليست واضحة تمامًا بعد. ومع ذلك ، فمن المثير للاهتمام أن المناطق الجينية الأربعة عشر التي ذكرتها من قبل تحتوي على جينات مرتبطة بالكوليسترول ومستويات الأنسولين ومقاومة الأنسولين ، وكلها مرتبطة بمرض السكري من النوع 2 ونتائج القلب والأوعية الدموية. يبدو أن هناك بعض الارتباط أيضًا على المستوى الجيني لكننا لا نعرف كيف يعمل ذلك حتى الآن.

س: ما هي أهم خطوط البحث التي تم تطويرها خلال السنوات الخمس أو العشر الماضية؟

CL: من وجهة نظري الشخصية خلال السنوات الخمس الماضية ، أعتقد أن أكبر خطوة إلى الأمام كانت أن وكالات التمويل سمحت لنا بالتوسع وإجراء المزيد من الدراسات على نطاق عالمي ، أو الدراسات الجينية على نطاق عالمي يجب أن أقول. بدأنا بفحص الجينوم بأكمله من خلال النظر إلى حوالي 3 ملايين متغير جيني في آلاف الأفراد ، وهو أمر لم نكن نحلم به منذ 10 سنوات ، وقد كان ذلك ناجحًا حقًا. لقد بدأ هنا في أكسفورد في الواقع حيث حددنا الجين الأول المرتبط بالسمنة: جين FTO - فعل فريقنا ذلك. تبع هذا النجاح بسرعة تحديد جين السمنة الثاني MC4R وهو أيضًا جين يؤثر على الأشكال أحادية الجين ، والأشكال المتطرفة للبدانة المبكرة حتى الآن لدينا أكثر من 30 منطقة جينية تؤثر على السمنة بشكل عام. الأمر الثاني هو أنه يتم التعرف عليه أكثر فأكثر الآن لأن السمنة الكلية لا تمنحك الصورة الكاملة ، إنها لا تشرح كل شيء. توزيع الدهون له تأثير واضح ومستقل على النتائج الأيضية للسمنة. مع وجود 14 منطقة جينية حددناها هناك ، فإن أحد أكثر الأشياء إثارة هو أنها تعتمد على الأدلة الموجودة بالفعل على أن توزيع الدهون ونمطها يؤثران على المسارات التي لها علاقة بنمو الخلايا الدهنية وأيضًا مستودعات الدهون الموجودة في الجسم حيث تتراكم الدهون عند زيادة الوزن ، وكما تحدثت من قبل ، فإن هذا يرتبط ارتباطًا وثيقًا بأمراض القلب والأوعية الدموية ومرض السكري من النوع 2. هذا مثير حقًا وهذا شيء ظهر للتو من السنوات القليلة الماضية.

س: هل يمكن أن يؤدي هذا إلى علاجات أفضل؟

CL: أعتقد أن العلاج الأفضل وربما الأسهل للسمنة هو تناول كميات أقل وممارسة الرياضة أكثر. ومع ذلك ، وكما نرى من عامة الناس اليوم ، فإن هذا لا يعمل حقًا ، لذا فنحن بحاجة إلى ابتكار استراتيجيات إدارة أفضل لمساعدة الناس. أعتقد أن بياناتنا هي الخطوة الأولى نحو فهم سبب كون بعض الأشخاص أكثر عرضة من غيرهم لاكتساب الوزن ، وزيادة الوزن في أوضاع غير مواتية في الجسم. عندما نفهم ذلك ، نأمل أن يؤدي ذلك إلى علاجات أفضل وإجراءات وقائية أفضل.

س: ما هي أهمية خط البحث الخاص بك؟ لماذا يجب أن نضع المال فيه؟

CL: السمنة اليوم آخذة في الارتفاع بين السكان. أعتقد أنني قرأت الأرقام الأسبوع الماضي في المملكة المتحدة أن متوسط ​​مؤشر كتلة الجسم هو 25.4 لدى البالغين ، مما يعني أن الشخص البريطاني العادي يعاني الآن من زيادة الوزن.علاوة على ذلك ربع البالغين يعانون من السمنة المفرطة. مع ذلك ، فهذا يعني أن نصف السكان معرضون لخطر متزايد لكل هذه الاضطرابات بما في ذلك أمراض القلب والأوعية الدموية والسرطان وما إلى ذلك ، لذلك يعد هذا تأثيرًا اجتماعيًا واقتصاديًا كبيرًا تسببه السمنة. ومن المثير للاهتمام مرة أخرى ، إذا نظرت إلى الأفراد البالغين ، فإن مؤشر كتلة الجسم ليس مقياسًا مباشرًا للودائع لدينا ، إنه مقياس بديل. إذا أضفت عنصر توزيع الدهون الذي يوصى به أكثر فأكثر في إرشادات مختلفة ، وتتحدث NHS عن ذلك أيضًا ، فسترى أن حوالي 20 ٪ من البالغين الآن في فئة عالية الخطورة للإصابة بهذه الاضطرابات الأيضية . هذا شيء يكلف المجتمع مليارات الجنيهات وهناك أيضًا وصمة عار اجتماعية وشخصية مرتبطة بالسمنة وشكل الجسم غير المناسب على ما أعتقد.

س: كيف يتناسب بحثك مع الطب الترجمي داخل القسم؟

CL: آمل أن مناطق الجينات والجينات المختلفة التي نجدها ستفسح المجال لأول نقطة انطلاق نحو العلاج ، وعندما نتمكن من تحديد الآليات والمسارات الأساسية التي تعمل بها المجموعات المختلفة داخل القسم والتي تعمل مع الجوانب الانتقالية للطب ، و يمكن لشركات الأدوية أيضًا الاستفادة من هذه المعلومات وتقديم علاجات أفضل وكذلك وقاية أفضل.


ملاحظات ختامية

البكتيريا والفطريات كائنات متعددة الأوجه تحتوي على عدة طبقات من التعقيد. هنا ، استعرضنا بإيجاز الأحداث الرئيسية التي شكلت مجال تصميم ناقلات لجميع تلك الكائنات الحية الدقيقة على مدى العقود الماضية. باختصار ، المتطلبان الرئيسيان للناقلات الاستثنائية هما التنوع والنمطية. مما لا شك فيه أن معظم الأدوات بُنيت بناءً على نماذج كائنات حية من كل مملكة: ه & # x000a0coli و & # x000a0cerevisiae. ومع ذلك ، فإننا ندرك الآن أن هذه التقنيات في طريق لا مفر منه للتوسع إلى الكائنات الحية الدقيقة الأخرى نظرًا لأهميتها الهائلة في الصحة والصناعة. تعد & # x02010host & # x02010 متجهات النطاق ومتجهات النقل المكوكية جزءًا من هذا الحل. من الناحية المثالية ، يجب أن تعمل نفس الأداة مع كل من النموذج والكائن الحي المستهدف الآخر. لن يفيد تعدد الاستخدامات العلوم الأساسية فحسب ، بل سيساعد أيضًا في البحث عن منتجات ميتاجينومية جديدة. ومع ذلك ، فإن النمطية ، كما ذكر عدة مرات خلال المراجعة ، هي المرحلة النهائية التي يجب أن نصل إليها لدخول العصر الجديد للبيولوجيا التركيبية والنواقل المستندة إلى # x02010. لتحقيق ذلك ، نحتاج إلى توصيف وتوحيد كامل وشامل لجميع الأجزاء البيولوجية ، سواء داخل الأنظمة البيولوجية أو خارجها. ربما لن نعثر على & # x02018one متجه لهم جميعًا & # x02019 ، حيث يمكن استخدام منصة واحدة لأي كائن حي محل اهتمام. لذلك ، نتوقع موقفًا يتم فيه إنشاء قواعد التصميم الأساسية في أكبر عدد ممكن من الكائنات الحية النموذجية ثم يتم تطبيقها على كائنات جديدة باستخدام تقنيات تخليق الحمض النووي التي تتناقص تكلفتها باستمرار.


شاهد الفيديو: الأوبيرون وتنظيم الجينات في البكتيريا. الأحياء. تنظيم الجينات (يونيو 2022).


تعليقات:

  1. Voodoonos

    إجابة جيدة ، تهانينا

  2. Durwin

    منحت ، هذه معلومة رائعة

  3. Tony

    أعتذر لكوني خارج الموضوع قليلاً ، لكن ما هي خدمة RSS؟ وكيفية الاشتراك بها؟



اكتب رسالة